كارايي انتخاب ژنومي در برنامه هاي اصلاح نژاد مرغان بومي

Efficiency of Genomic Selection in Breeding Programs of Native Hens

توسعه انتخاب ژنومي استراتژي هاي جديدي را در اصلاح نژاد حيوانات ايجاد كرده است. هدف از اين مطالعه بررسي كارايي انتخاب ژنومي در برنامه هاي اصلاح نژادي مرغان بومي بود. در اين مطالعه يك سناريوي مرجع با تعداد 3380 پرنده با استفاده از اطلاعات فنوتيپي و شجره اي شبيه سازي شد و پيشرفت ژنتيكي با روش قطعي توسط نرم افزار ZPLAN+ ارزيابي گرديد. اين سناريو با دو برنامه اصلاحي ژنومي به منظور تعيين بهترين استراتژي براي كاربرد اطلاعات ژنومي در مرغان بومي مقايسه شد. در سناريوي ژنومي اول از اطلاعات ژنومي هر دو جنس و در سناريوي ژنومي دوم تنها از اطلاعات ژنومي خروس ها استفاده شد. در هر دو سناريو ژنومي تعداد كانديداهاي انتخابي نر بين 800 تا 1600 خروس متغير بود و چهار اندازه از جمعيت مرجع (500، 1000، 1500 و يا 2000 پرنده) در نظر قرار گرفت. فاصله بين نسلي در سناريوي مرجع برابر با 14/5 ماه بود. در هر دو سناريوي ژنومي، انتخاب در زودترين زمان ممكن از لحاظ بيولوژيكي انجام شد. به همين دليل فاصله بين نسلي به 8 ماه كاهش يافت. در سناريوهاي ژنومي رشد ژنتيكي و سود اقتصادي برنامه اصلاحي افزايش يافت (9434880 ريال تا 10931310 ريال سود به ازاي هر واحد حيواني در سناريوي دو). دقت شاخص انتخاب در سناريوي مرجع براي مسير خروس ها 0/61 و براي مسير مرغ ها 0/63 بود. دقت در سناريوهاي ژنومي در مقايسه با سناريوي مرجع افزايش داشت (0/67 تا 0/76). اين مطالعه نشان داد افزايش دقت و كاهش فاصله بين نسلي در سناريوهاي ژنومي تاثير مثبت بر سود و رشد ژنتيكي داشت. بنابراين كاربرد اطلاعات ژنومي كارايي برنامه هاي اصلاحي را در مرغان بومي افزايش داد. با تكيه بر نتايج بدست آمده از اين مطالعه، مي توان انتخاب ژنومي را در برنامه هاي اصلاحي ژنومي مرغان بومي كشور به كار برد. براي كاهش هزينه ها نيز پيشنهاد مي شود كاربرد تراشه هاي SNP با تراكم پايين بررسي شود.

The development of genomic selection has created new strategies in animal breeding programs. The aim of this study was to investigate the efficiency of genomic selection in breeding programs of native hens. In this study, a reference scenario with birds using pedigree and phenotypic information was simulated and the expected genetic progress was derived deterministically with the software of ZPLAN+. The reference scenario was compared with two genomic breeding programs to determine the best strategy for implementing genomic information in breeding programs of native hens. In scenario I, the genomic information of both sexes was used, but in scenario II, only one's of males was used. In both scenarios, the number of genotyped male selection candidates was varied between and males and four size of the reference population including ( , , or birds) were considered. The generation interval of . months was in the reference scenario. In both genomic scenarios, breeders of both sexes were select at the biologically earliest possible age. So, the generation interval was reduced to eight months. All genomic scenarios increased the genetic gain and the economic profit of the breeding program (€ . to € . profit per animal unit in scenario II). The accuracy of the selection index in reference scenario was . and . for cocks and hens, respectively. This study showed that the increase of accuracy and decrease of general interval in genomic scenarios has a positive effect on the profit and genetic gain. So, application of genomic information increased the efficiency of breeding programs in native fowl. Based on the results of this study, genomic selection can be used in genomic breeding programs of native fowls. To reduce costs, it is also recommended to investigate the application of low-density SNP chips.