بررسي ژنتيكي شوورت ماهي نقره اي Sillago sihama در آبهاي شمال خليج فارس بر پايه توالي ژن سيتوكروم اكسيداز C زير واحد I

Genetic Analysis of Sand Whiting Sillago sihama from North Persian Gulf based on Cytochrome Oxidase C subunit I sequences

خانواده شوورت ماهيان (Sillaginids) از راسته سوف ماهي سانان (Perciformes)، نامزد مناسبي براي آبزي پروري در مناطق مصبي و كم عمق به شمار مي روند. اين خانواده داراي دست كم سه گونه در آبهاي خليج فارس مي باشد. بررسي ژنتيكي گونه غالب اين خانواده، شوورت ماهي نقره اي Sillago sihama با استفاده از ژن COI مورد ارزيابي قرار گرفت. در اين بررسي، تعداد 10 نمونه از گونه مورد نظر از سواحل هر يك از استان هاي بوشهر و هرمزگان صيد، شناسايي ريخت شناختي و بررسي ملكولي گرديد. استخراج DNA با استفاده از روش اصلاح شدهCTAB انجام شد. جهت انجام واكنش هاي زنجيره اي پليمراز از آغازگرهاي جهانيFISH F1 وFISH R1 استفاده گرديد. نتايج حاصل از تعيين توالي نشان داد كه قطعه تكثير شده، 627 جفت باز طول دارد. نتايج BLAST نشان دهنده همانندي بالا به گونه شوورت ماهي نقره اي بود، بنابراين داده هاي ملكولي منبطق بر رده بندي ريخت شناختي اين گونه بود. فاصله ژنتيكي كلي بين نمونه هاي دو ناحيه مذكور بر اساس Kimura 2- parameter، با استفاده از نرم افزار مگا 02/0 گرديد. ترسيم درخت فيلوژنتيكي به روش پيوند همجواري (NJ) در مقابل برون گونه (Acanthopagrus latus) نشان داد نمونه هاي دو استان از همديگر قابل تفكيك نيستند. با توجه به نتايج بدست آمده ، نمونه هاي بررسي شده داراي تبادل ژني بالا هستند و تمايز بالايي ميان دو استان هرمزگان و بوشهر ندارند. بنابراين درباره گونه شوورت ماهي نقره اي نمي توان دو جمعيت مجزا را بر اساس داده هاي اين بررسي در نظر گرفت.

Silaginidae family fish from Perciforms, are appropriate candidates for shallow water and coastal aquaculture. At least three species of this family represents in the Persian Gulf. Genetic analysis of Sand whiting Sillago sihama , the most common species of family performed using COI gene. During the present study 10 samples were collected from Bushehr and Hormozgan provinces coastal waters. DNA extracted by modified CTAB method. Polymerase chain reactions were performed using universal primers - FISHF1 and FISHR1-. Sequencing results showed a 627 bp amplified fragment. Performing BLAST supported high identity to Sillago sihama species, hence morphometric identification confirms molecular barcoding. Genetic distance of 0.02 was calculated between samples of two areas based on Kimura 2- parameter using Mega software. Constructed phylogenetic tree using neighbor joining method whereas the Acanthopagrus latus sequences was used as an outgroup revealed no differentiation between two stations samples. In conclusion based on the results of the present study, the gene flow was high among studied samples and no significant differentiation was observed between Bushehr and Hormozgan samples. In conclusion no discrete populations differentiated based on the results of the present study.