بررسي فيلوژنتيكي جدايه هاي جديد ايراني ويروس بادناي يك انجير بر اساس ترادف ژن پروتئين حركتي

بيماري موزائيك انجير گسترش جهاني دارد و به عنوان شايع ترين بيماري ويروسي در انجير شناخته مي شود. يكي از مهمترين ويروس هايي كه در اين بيماري نقش دارد، ويروس بادناي يك انجير (FBV 1) مي باشد. در تحقيق حاضر، روابط فيلوژنتيكي بين جدايه هاي ايراني و ساير جدايه هاي گزارش شده از اين ويروس مورد بررسي قرار گرفت. با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي ژن رمز كننده پروتئين حركتي ويروس، قطعه ي مورد انتظار به اندازه تقريبي 1090 جفت باز از ژنوم ويروس تكثير شد. قطعه ژني 12 جدايه در پلاسميد pTZ57R/T همسانه و تعيين توالي شد. ترادف هاي به دست آمده با ترادف هاي موجود در بانك ژن مقايسه و پس از همرديف سازي چندگانه، درخت فيلوژنتيكي بر اساس ژن پروتئين حركتي FBV 1 ترسيم شد. بر اساس آناليز فيلوژنتيكي، جدايه هاي FBV 1 در دو گروه متمايز دسته بندي شدند و جدايه هاي ايراني در دو زيرگروه با 99% مشابهت نوكلئوتيدي در گروه اول قرار گرفتند. در بررسي تبارزايي بر مبناي توالي اسيد آمينه اي، جدايه هاي مورد بررسي در سه گروه با 99 98 % مشابهت قرار گرفتند. جدايه هاي ايراني از تنوع ژنتيكي پايين تري در مقايسه با جدايه هاي آمريكايي برخوردار بودند و شرايط جغرافيايي در تنوع ژنتيكي جدايه هاي موجود تاثير داشت.