شناسايي QTL هاي عملكرد و صفات مرتبط با عملكرد برنج با استفاده از نقشه لينكاژي با تراكم بالاي نشانگرهاي SNP

برنج يكي از غلات مهم با تنوع بسيار خوب است كه به عنوان غذاي اصلي نيمي از جمعيت جهان استفاده مي شود. مكان يابي جايگاه هاي كنترل كننده صفات كمي يكي از روش هاي كاربردي و مهم براي مطالعه صفات مرتبط با عملكـرد است. در اين مطالعه تعداد 188 لاين (F4) برنج حاصل از تلاقي CSR28 و صدري به همراه والدين خود جهت بررسي فنوتيپي و ژنوتيپي مورد ارزيابي قرار گرفت. هدف از اين مطالعه تهيه نقشه پيوستگي با درجه اشباع بالا با استفاده از نشانگرهاي SNP (Infinium Illumina 6K SNP chip) و شناسايي مكان هاي ژني كنترل كننـده صفات مرتبط با عملكـرد در 188 لاين جمعيت F4 است. مكان يابي جايگاه هاي كنترل كننده صفات كمي منجر به شناسايي 21 QTL براي صفات مورد مطالعه بر روي كروموزوم هاي 1، 2، 3، 5، 7، 8 و 10 شد. براي تعداد دانه هاي پرشده در بوته يك QTL (qFG_N-3-1) روي كروموزوم 3 شناسايي شد. سه QTL (qSpkF_N-2-1، qSpkF_N-3-1 و qSpkF_N-5-1) براي درصد باروري روي كروموزوم هاي 2، 3 و 5 مكان يابي شد كه 28/29 درصد از واريانس فنوتيپي را توجيه كردند. يك QTL (qGY_N-8-1) براي عملكرد دانه در فاصله نشانگري 9037125 و 9049928 روي كروموزوم 8 مكان يابي شد. در نهايت، علاوه بر شناخت QTL هاي جديد مي توان ديگر QTL هايي كه در نواحي مشابه با مطالعات قبلي شناسايي شده را به عنوان QTL-هاي داراي اعتبار معرفي كرد كه مناسب براي برنامه هاي اصلاحي به كمك نشانگر است.