عنوان مقاله :
كاربرد الگوريتم uMelt SM در آناليز منحني ذوب Real-time PCR
پديد آورندگان :
خارابي ماسوله ، اناهيتا - گروه علوم گياهي و بيوتكنولوژي , سعيدي ، عباس - گروه علوم گياهي و بيوتكنولوژي
كليدواژه :
qPCR , منحني ذوب , آزمايش , پيش بيني , uMelt SM.
چكيده فارسي :
يكي از چالش هاي موجود در تفسير نتايج qPCR ، اطمينان از اختصاصي بودن قطعات تكثير شده است كه براي بررسي آن از آناليز منحني ذوب استفاده مي شود. پيك هاي اضافي در منحني ذوب هميشه نشان دهنده يك مشكل نيست، به همين منظور در اين مقاله يك ابزار مبتني بر وب به نام uMelt SM به عنوان راهكاري كاربردي و ساده براي آناليز صحيح منحني ذوب به محققين پيشنهاد مي گردد كه امكان پيش بيني منحني ذوب DNA و پروفيل هاي واسرشته سازي را با وضوح بالاي فلورسنت از محصولات PCR فراهم مي كند. نتايج اين مطالعه نشان داد كه منحني هاي ذوب براساس چه پارامترهايي توليد شده و الگوريتم مناسب براي نحوه كار با اين نرم افزار ارائه گرديد. در نهايت ژن هاي اكتين و سوپراكسيد ديسموتاز از قارچ Pyricularia oryzae به عنوان الگوي مناسب براي تعيين منحني پيش بيني شده با استفاده از اين نرم افزار ارائه گرديد و منحني Real-time PCR نيز ترسيم شد. براساس نتايج منحني ذوب با استفاده از نرم افزار uMelt SM در مقايسه با منحني ذوب دستگاه Real-Time PCR تطابق بالايي را نشان مي دهد كه اين نتايج تأييدي بر مزيت هايي همچون سهولت استفاده، صرفه جويي در زمان، هزينه و تلاش در بخش تجربي با استفاده از اين نرم افزار مي باشد.
عنوان نشريه :
بيوتكنولوژي كشاورزي
عنوان نشريه :
بيوتكنولوژي كشاورزي