تخمين عدم تعادل پيوستگي و پويش كل ژنومي جهت شناسايي جايگاه هاي ژني تحت انتخاب مرتبط با وزن بدن در گوسفندان نژاد زندي

وزن بدن از مهمترين معيارهاي تعيين كننده سود اقتصادي در صنعت پرورش گوسفند است. در مطالعات پيوستگي و انتخاب ژنومي تعيين ميزان و گستره عدم تعادل پيوستگي (LD) در تشخيص تعداد نشانگر مورد نياز و اندازه نمونه، اهميت بسزايي دارد. علاوه براين، انتخاب براي افزايش فراواني موتاسيون هاي جديدي كه فقط در برخي از زيرجمعيت ها سودمند هستند باعث باقي گذاشتن نشانه هايي در سطح ژنوم مي شود. اغلب اين مناطق با ژن ها و QTLهاي مرتبط با صفات مهم اقتصادي در ارتباط هستند. بنابراين، هدف اين تحقيق مطالعه گستره LD و شناسايي مناطقي از ژنوم گوسفندان نژاد زندي با وزن بدن متفاوت بود كه در طي سال هاي مختلف به صورت مصنوعي يا طبيعي انتخاب شده اند. بدين منظور، از 73 رأس گوسفند زندي نمونه خون تهيه شد و با استفاده از آرايه هاي SNPChip 50 K شركت ايلومينا ژنوتيپ 54241 نشانگر بر مبناي آخرين نسخه Oar_4.0 ژنوم گوسفند تعيين شد. پس از مراحل كنترل كيفي، در نهايت 40879 نشانگر SNP مربوط به 71 حيوان آناليز شدند. مقدار LD با محاسبه آماره r^2 بين تمام جفت جايگاه ها از طريق نرم افزار PLINK محاسبه شد. براي شناسايي نشانه هاي انتخاب بر پايه روش هاي عدم تعادل پيوستگي از آزمون هموزيگوسيتي هاپلوتايپي بسط داده شده جمعيت تلاقي (XP-EHH) استفاده شد. در اين مطالعه گستره مفيد عدم تعادل پيوستگي در 40K برابر با 0/2 =r^2 برآورد شد. نتايج اين تحقيق 10 منطقه ژنومي روي كروموزوم هاي 1، 2، 3، 5، 6، 9، 12، 13، 21 و 22 را شناسايي كرد. تجزيه و تحليل بيوانفورماتيكي نشان داد كه برخي از اين مناطق ژنومي با ژن هاي مؤثر بر صفات رشد، متابوليسم چربي، توسعه سيستم اسكلتي، متابوليسم انرژي و كيفيت گوشت مانند ژن هاي FBP1، FAM184B، PKD2، FGF19، SPP1، MEPE، CAPN2 همپوشاني دارند.