بازسازي، آناليز و مقايسه توپولوژي شبكه¬هاي ژني مبتني برداده¬هاي RNA-Seq دخيل در صفات چند فاكتوره توليد مثلي و باروري

هدف: عليرغم اهميت باروري در گونه¬هاي مختلف، موفقيت¬هاي كمي در فهم اساس باروري از منظر لايه‌هاي مختلف OMICS به دست آمده است. براي فهم بهتر اساس مولكولي باروري، نيم‌رخ ترانسكريپتوم بافت¬هاي مختلف در گاو مورد بررسي قرار گرفت. مواد و روش¬ها: بافت¬هاي كبد، عضله، اندومتريوم و جسم زرد در گاوهايي با شايستگي ژنتيكي بالا و پايين در صفات توليدمثلي با استفاده از داده‌هاي RNA-Seq مورد پژوهش قرار گرفت. در ابتدا فهرست ژن هاي مربوط به جسم زرد كه تفاوت بياني داشتند تهيه و در ادامه شبكه هم بيان ژني براي اين فهرست ژني ايجاد شد. نتايج: تعداد ژن هاي محدودي در بافت¬هاي كبد، عضله و اندومتريوم تفاوت بيان نشان دادند ولي در مقابل تعداد قابل توجهي ژن در جسم زرد تفاوت بياني از خود نشان دادند. بر اين اساس،. تعداد 264 ژن و 6 ماژول عملكردي بعد از طبقه بندي ژن ها براي جسم زرد شناسايي شد. همه اين ژن ها حداقل در يكي از فرآيندهاي زيستي از قبيل پروتئولايسيز، سازماندهي آكتين، پاسخ ايمني، چسبندگي سلولي، تمايز سلولي و متابوليك چربي نقش داشتند(p 0.01). نتيجه¬گيري: شناسايي ژن ها و بازسازي شبكه هاي تنظيمي مي¬تواند افق جديدي در راستاي فهم چگونگي سازو كار فرآيندهاي زيستي باز كند. همچنين اين پژوهش فهم ما را در نقش بافت¬هاي مختلف روي باروري در گاوهاي شيري را نشان مي دهد.