بررسي اثر ژن‌هاي مرتبط با ميتوپروتئوم‌ بر رشد ماهيچه سينه مرغ بومي اصفهان به‌وسيله داده RNAseq

اين آزمايش به منظور بررسي و شناسايي تفاوت‌هاي ژنتيكي و مسيرهاي متابوليكي مرتبط با ميتوكندري بين توده مرغ بومي اصفهان و يك سويه جوجه تجاري راس 708 با سرعت رشدهاي متفاوت، انجام شد. بدين منظور از روش توالي‌يابي RNAseq با استفاده از چهار نمونه ماهيچه سينه 28 روزگي استفاده شد. مقايسه آماري بيان ژن‌هاي توالي‌يابي شده در مرغ بومي و جوجه تجاري، 606 ژن با تفاوت معني‌دار را مشخص نمود و از اين تعداد 249 ژن در مرغ بومي و 357 ژن در جوجه تجاري افزايش بيان داشتند. بر اساس نتايج بيان ژن‌ها در مرغ بومي، فاكتور رونويسي FoxO3 موجب فعال شدن مسير آتروفي ليگازهاي يوبيكويتيني E3 و افزايش شكست پروتئين و در نتيجه كاهش حجم ماهيچه اسكلتي در مقايسه با جوجه تجاري شده است. هيپوكسي و تنظيم فرآيند متابوليكي گونه‌هاي اكسيژن فعال (ROS) از مهم‌ترين فرآيندهاي بيولوژيكي فعال در مرغ بومي بودند. بررسي و مقايسه ژن‌هاي مرتبط با پروتئوم ميتوكندريايي نشان داد در اين مرغ تغييرات معني‌داري در بيان بسياري از پروتئين‌هاي وابسته به رشد و تنظيم‌كننده رونويسي وجود دارد. اين تغييرات نشان‌دهنده برنامه سازگاري پيچيده‌اي است كه شكست پروتئين را تسهيل نموده و سوخت گلوكز در ماهيچه را كاهش مي‌دهد. اين مسيرهاي متابوليسمي در جهت كاستن سطح نيازمندي‌هاي مرغ بومي به گونه‌اي تكامل يافته‌اند تا توان اين مرغ را در غلبه بر شرايط و تنش‌هاي محيطي و تحمل كمبودهاي غذايي تقويت نمايند.