شناسايي miRNA هاي دخيل در مسير گل دهي گياه چغندرقند (.Beta vulgaris L)

يكي از فرآيندهاي كنترلي در بسياري از گياهان از جمله چغندرقند انتقال از مرحله رشد رويشي به زايشي مي­باشد كه توسط شبكه پيچيده­اي از پروتئين­ها تنظيم مي­شود. تاكنون چندين مسير تنظيمي دخيل در مسير گل­دهي و بولتينگ و ژن­هاي موثر در آن­ها در گياه مدل آرابيدوپسيس شناسايي شده است. يك مسير موثر در انتقال از مرحله رويشي به زايشي مسير وابسته به سن است كه تحت­تاثير دو miRNA172 و miRNA156 مي‌باشد. ژن­هاي كدكننده miRNA ها در بين گياهان بسيار گسترده و حفاظت­شده هستند. در اين تحقيق، براي شناسايي توالي اين دو ژن در ژنوم چغندرقند، توالي آن­ها از چندين گياه جمع­آوري و با توالي­هاي Refseqgenomic چغندرقند مورد هم­رديفي قرار گرفتند. نواحي با توالي مشترك شناسايي و اطلاعات آن­ها به طور دقيق مورد بررسي قرارگرفت. نتايج نشان داد كه در ژنوم چغندرقند براي ژن كدكننده miR156 فقط 127 جفت باز از كروموزوم شماره 2 و ژن كدكننده miR172 فقط 110 جفت ­باز از كروموزوم شماره 9 داراي توالي­هاي كامل پيش­ساز miRNA بودند. جداسازي ژن كدكننده miR156 از ژنوم گياه چغندرقند، با طراحي آغازگرهاي اختصاصي از نواحي ابتدا و انتهاي ژن انجام گرفت. ژن كدكننده miR156 توسط تكنيك واكنش زنجيره­اي پليمراز و با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي MIRF و MIRR از روي DNA ژنومي چغندرقند تكثير شد. همانگونه كه انتظار مي­رفت قطعه DNA 127 جفت باز تكثير شد و در نهايت از طريق توالي­يابي مشابهت 99 درصدي توالي تكثير شده با توالي شناسايي شده ژن كدكننده miR156 به دست آمد و صحت توالي شناسايي شده به عنوان ژن كدكننده miR156 در چغندرقند تأييد گشت. شناسايي و  مطالعه اين ژن­هاي مؤثر در فرآيند گل­دهي راه را براي قابليت بررسي عملكرد دقيق آن­ها در فرآيندهاي گل­دهي و بولتينگ چغندرقند خواهد گشود.