بررسي تنوع ژنتيكي جدايه‌هاي كلبسيلا پنومونيه دامي و انساني با استفاده از روش ERIC-PCR و تعيين الگو حساسيت آنتي‌بيوتيكي

كلبسيلا پنومونيه، از جمله پاتوژ‌نهاي فرصت طلب و عامل عفونت در انسان و حيوانات مي‌باشد. مقاومت به آنتي بيوتيك در جدايه‌هاي كلبسيلا پنومونيه در حال افزايش است. تست حساسيت ضد ميكروبي قبل از تجويز آنتي‌بيوتيك‌ها، لازم به نظر مي‌رسد. هدف از مطالعه حاضر تعيين تايپ جدايه‌هاي باليني و دامي كلبسيلا پنومونيه و ارزيابي حساسيت آنتي‌بيوتيكي بود. در مجموع 100 جدايه باليني و دامي كلبسيلا پنومونيه از شهرستان بابك جمع‌آوري شد. حساسيت آنتي بيوتيكي با روش كربي بائر با توجه به دستورالعمل CLSI انجام شد. سپس، استخراج DNA ژنومي با استفاده از كيت DNA انجام و واكنش زنجيره‌اي پليمراز با پرايمر ERIC1 و ERIC2 انجام گرديد. نتايج نشان داد كه تمامي سويه‌هاي تحت مطالعه (100%) به آنتي‌بيوتيك‌هاي آمپي سيلين و آميكاسين مقاوم بودند. بيشترين و كمترين ميزان مقاومت مريوط به تتراسيكلن (53 سويه؛ 3/88%) و ايمي پنم (8 جدايه؛ 3/13%) بود. نتايج حاصل از تجزيه خوشه‌اي و ترسيم دندروگرام بر اساس شباهت‌هاي ژنتيكي، نمونه‌هاي مورد مطالعه را به هفده گروه مجزا تفكيك نموده است. با توجه به يافته هاي اين مطالعه، مقاومت به آنتي بيوتيك در بين جدايه‌هاي كلبسيلا پنومونيه در حال افزايش مي‌باشد. علاوه بر اين، توال‌هاي ERIC داراي جفت بازي هستند كه حاوي تكرارهاي معكوس و مركزي به شدت حفاظت شده بوده و در نواحي خارج ژني ژنوم باكتري‌ها قرار گرفته اند و در تعيين تنوع ژنتيكي ميان تمامي جدايه پيچيدگي كمتري دارند اما تفكيك خوبي در سطح سويه ايجاد مي‌كنند.