شناسايي گونه‌هاي لاكتوباسيل مزوفيل موجود در روده ماهيان سفيد (Rutilus kutum Kamensky, 1901) درياي خزر با تست تأييدي PCR

لاكتوباسيل ها گونه هاي باكتري گرم مثبت، بدون اسپور، كاتالاز منفي ميله اي مي باشند كه داراي نقش اكولوژيكي مهمي در دستگاه گوارش مي باشند كه شامل توليد مواد ضد ميكروبي، افزايش پاسخ سيستم ايمني و افزايش قابليت دسترسي مواد مغذي است. جهت شناسايي لاكتوباسيل هاي موجود در روده ماهيان سفيد اقدام به صيد تعداد 40 قطعه ماهي به صورت تصادفي از درياي خزر گرديد. سپس نمونه ها تحت شرايط استريل و در مجاورت يخ به آزمايشگاه ميكروب شناسي دانشكده دامپزشكي دانشگاه آزاد واحد تبريز منتقل و بعد از بررسي فنوتيپيكي و بيوشيميايي، 10 نمونه لاكتوباسيل موردنظر براي تشخيص گونه ها بر اساس ساختار مولكولي ژن srDNA 16، اقدام به استخراج DNA و شناسايي لاكتوباسيل ها با پرايمر اختصاصي نموده و سپس به منظور شناسايي اوليه گونه ها از آنزيم برشي Taq1 استفاده گرديد. سپس 3 نمونه متفاوت به منظور تشخيص قطعي جهت توالي يابي ارسال گرديد. نتايج توالي يابي حاكي از تشابه 9997% توالي هاي موردنظر با توالي هاي ژن هاي SrDNA 16 ثبت شده در بانك اطلاعاتي براي گونه لاكتوباسيلوس فرمنتوم بود و تنها يك نمونه تشابه 89% با گونه لاكتوباسيلوس فرمنتوم (Lactobacillus Fermentum) داشت كه نمونه موردنظر براي توالي يابي به صورت پارشيال فرستاده شد و بعد توالي يابي با شماره ژن JQ906262 تحت عنوان Lactobacillus sp. RU1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence در سايت ncbi ثبت شد.