شناسايي مولكولي وتجزيه وتحليل بيوانفورماتيك وبررسي فيلوژنتيكي لاكتوباسيلوس پلانتاروم در نمونه هاي خمير ترش صنعتي و سنتي

باكتري‌هاي اسيد لاكتيك (LAB) گروهي از باكتري‌هاي گرم مثبت، بدون اسپور هستندكه عموما به‌عنوان ارگانيسم‌هاي ايمن در نظر گرفته مي‌شوند.از آنجايي كه اين باكتري ها توانايي توليد تغييرات مطلوب را در طعم و بافت غذا دارا هستند و بنا به اهميت لاكتوباسيل‌ها در سلامت انسان، شناسايي مولكولي و بررسي فيلو ژنتيكي لاكتوباسيل هاي جداشده از خميرترش نمونه محلي تربت جام و المان بر اساس توالي16s RNA مهمترين هدف اين مطالعه است.بدين منظور خميرترش بر اساس خصوصيات ارگانولپتيكي (عطر و طعم) از شهرستان تربت جام جمع‌آوري گرديد.نمونه DNA از خميرترش آلمان به‌طور مستقيم استخراج گرديد. پس از استخراج DNA تكثير قطعه253جفت بازي از ژن 16s RNA ريبوزومي توسط آغازگرهاي اختصاصي انجام گرفت. سپس قطعات تكثير شده تعيين توالي شدند. نتايج به‌دست آمده نشان داد كه در موقعيت 182 و 205 به‌ترتيب تغييرات نوكلئوتيدي A/Cو T/C وجود دارد كه در موقعيت 182 اسيدآمينه هيستيدين به پرولين و در موقعيت 208 اسيد گلوتامين به كدون پايان تغيير داده شد همچنين توالي نهايي بدست آمده از نمونه تربت با طول 253 جفت باز شامل1/24 درصد آدنين، 1/22 درصد گوانين، 3/27 درصد سيتوزين و 5/26درصد تيمين بود. نتايج فيلوژنتيكي با استفاده از روش NeighborJoining نشان داد، كه باكتري لاكتوباسيلوس پلانتاروم جدا شده ازخميرترش نمونه محلي تربت جام كمترين فاصله ژنتيكي با آلمان، چين و هلند و بيشترين فاصله ژنتيكي با لاكتوباسيلوس پلانتاروم فرانسه دارد.