عنوان مقاله :
تجزيه و تحليل غني سازي مجموعه هاي ژني با استفاده از مطالعه گسترده پويش ژنوم براي شناسايي ژن ها و مسيرهاي زيستي مرتبط با دوقلوزايي در گوسفند بلوچي
پديد آورندگان :
اسماعيلي فرد ، سيد مهدي - دانشكده علوم دامي و شيلات , حافظيان ، سيد حسن - دانشكده علوم دامي و شيلات دانشگاه علوم كشاورزي و منابع طبيعي ساري , قلي زاده ، محسن - دانشكده علوم دامي و شيلات دانشگاه علوم كشاورزي و منابع طبيعي ساري , عبدالهي آرپناهي ، رستم - دانشكده علوم دامي
كليدواژه :
دوقلوزايي , گوسفند بلوچي , SNP , GSEASNP , GWAS
چكيده فارسي :
گوسفند بلوچي يكي از نژادهاي بومي ايران است كه از شرق كشور منشا گرفته و با شرايط آب و هوايي آن منطقه سازگار شده است. بازده اقتصادي اصلاح نژاد گوسفند به طور واضحي با بازده توليدمثل ميشها مرتبط است. در اين پژوهش، صفت دوقلوزايي به عنوان يك صفت توليدمثلي مهم مورد بررسي قرار گرفت. جهت انجام اين پژوهش از دادههاي ژنوتيپي 91 راس ميش بلوچي كه با استفاده از ريزآرايه گوسفندي 50k شركت ايلومينا تعيين ژنوتيپ شده بودند، جهت پويش ژنوم و شناسايي ژنهاي مرتبط با دوقلوزايي استفاده شد. بدين منظور از مدل تكرارپذيري تعميم يافته استفاده شد. در مرحله بعد، از تجزيه غنيسازي مجموعههاي ژني جهت شناسايي طبقات عملكردي مرتبط با دوقلوزايي استفاده شد. در اين پژوهش تعداد شش نشانگر SNP واقع بر كروموزومهاي 1، 3، 10، 15 و 25 شناسايي شدند كه با ژنهاي CTH، ANKRD13C، SRSF11، PTGER3، LDHB، LRRC40 و KCNMA1 مرتبط بودند. همچنين در تجزيه غنيسازي مجموعههاي ژني، تعداد 25 مسير با صفت دوقلوزايي مرتبط بودند (P
عنوان نشريه :
تحقيقات توليدات دامي
عنوان نشريه :
تحقيقات توليدات دامي