چندشكلي و بيان دو پروتئين LysMRLK در سيب زميني قبل و بعد از بروز بيماري بلايت زودرس

چكيده گيرنده­هاي (LysMRLKs) Lysin Motif Receptorlike Kinases، به­ دليل وجود موتيف ليزين ((LysM، به كيتين آزاد شده از ديواره­ي قارچ­ها متصل و سبب فعال شدن آبشاري از پروتئين­ها و در نهايت سبب افزايش مقاومت به پاتوژن­ها مي­شوند. براي بررسي بيان LysMRLKs احتمالي ژنوم سيب زميني در يك رقم حساس (Russet Burbank) و يك ژنوتيپ نسبتاً مقاوم (F06037) به Alternaria solani، ميزان بيان و توالي LysM آنها به روش­هاي بيوانفورماتيكي و مولكولي مطالعه شد. در مجموع 35 پروتئين LysMRLKs در ژنوم سيب زميني شناسايي شد كه از اين تعداد، 26 پروتئين بدون LysM و تعداد پنج وچهار پروتئين به ترتيب داراي يك يا دو LysM بودند. از نه گيرنده LysMRLKs ، تعداد دو گيرنده LysMRLKs در اثر آلودگي­ به A. solani افزايش بيان نشان دادند. پروتئين PGSC0003DMP400061331 با دو LysM بيان بيشتري در مقايسه با پروتئين PGSC0003DMP400060418 با يك LysM داشت. اين پروتئين­ها به ترتيب با پروتئين CERK1 آرابيدوپسيس (AB367524) 98 و 81 درصد شباهت داشتند. همرديفي ناحيه­ي LysM اين دو پروتئين با يكديگر و با ناحيه­ي همولوگ در پروتئين CERK1 آرابيدوپسيس نشان داد كه دو LysM پروتئين PGSC0003DMP400061331 در دو رقم تفاوتي نداشتند، اما در LysM اول پروتئين PGSC0003DMP400061331 يك ناحيه به توالي quot;NRD quot; وجود دارد كه در LysM دوم همين پروتئين و پروتئين CERK1 آرابيدوپسيس ديده نمي­شود و به نظر مي­رسد كه حاصل حذف يا اضافه شدگي باشد. با انجام روش­هاي ويرايش ژنوم مي­توان نقش اين ژن­ها را در موضوع مقاومت يا حساسيت به قارچ A. solaniمشخص نمود و از نتايج حاصل براي توليد گياهان تراريخت مقاوم استفاده كرد.