پديد آورندگان :
زرندي ، فاطمه - گروه بيوتكنولوژي كشاورزي , زرندي ، فاطمه - گروه بيوتكنولوژي كشاورزي , شكوهي فر ، فرهاد - پژوهشكده علوم گياهي , شكوهي فر ، فرهاد - پژوهشكده علوم گياهي , شريف نبي ، بهرام - گروه گياهپزشكي , شريف نبي ، بهرام - گروه گياهپزشكي , سيدطباطبايي ، بدرالدين ابراهيم - گروه بيوتكنولوژي كشاورزي , سيدطباطبايي ، بدرالدين ابراهيم - گروه بيوتكنولوژي كشاورزي , بني هاشمي ، ضياء الدين - گروه گياهپزشكي , بني هاشمي ، ضياء الدين - گروه گياهپزشكي
چكيده فارسي :
قارچ‌هاي بيماريزاي گياهي جهت غلبه بر سيستم دفاعي گياه از ابزار مختلفي بهره مي‌گيرند. تركيبات فيتوآنتيسيپين از جمله مواد دفاعي است كه در گياه جهت جلوگيري از حمله بيمارگرها توليد مي‌شود. آنزيم توماتيناز جهت تجزيه فيتوآنتيسيپين و غلبه بر سيستم دفاعي گياه توسط طيفي از قارچ‌ها از جمله تعدادي از فرم‌هاي اختصاصي قارچ F. oxysporum توليد مي‌شود. با هدف رديابي توالي كد كننده آنزيم توماتيناز در فرم اختصاصي Fusarium oxysporum f. sp. melonis (Fom) آغازگرهاي اختصاصي بر اساس توالي محافظت شده بالادست و پائين دست توالي كدكننده ژن FoTom1 گزارش شده از فرم اختصاصي .Fusarium oxysporum f. sp. lycopercisi (Fol) طراحي شد. استخراج DNA از نژاد يك، شايع در استان خراسان، انجام شد و واكنش تكثير با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي صورت گرفت. الگوي الكتروفورزي محصول واكنش حضور يك تك باند در اندازه مورد انتظار را تأييد نمود. قطعه تكثير شده بصورت دو جهته توالي‌يابي شد و با توالي گزارش شده از فرم اختصاصي Fol مورد مقايسه قرار گرفت. نتايج توالي يابي با استفاده از برنامه Vector NTi V11 بر هم منطبق شد و با توالي رفرنس همرديفي انجام شد. نتايج نشان داد در سطح نوكلئوتيدي 14 جهش در توالي شناسائي شده وجود دارد كه از اين بين 7 جهش در سطح توالي پروتئيني نيز بروز مي‌يابند. آناليز توالي با استفاده از برنامه Pfam وجود يك توالي سيگنال پپتيد و يك دومين هيدرولازي را در توالي شناسائي شده تأييد نمود. اين نتايج نشان داد كه توالي رديابي شده ميتواند همولوگ ژن توماتيناز در ژنوم فرم اختصاصي Fom باشد. اين توالي Fom-Tom نامگذاري شد و در بانك ژن با شماره بازيابي MF178403 ثبت شد. با هدف پيش‌بيني اثر جهش‌ها شناسائي شده در عملكرد ژن توماتيناز آناليزهاي نرم‌افزاري انجام شد كه نشان داد جهش‌هاي رخ داده در توالي دومين هيدرولازي ساختمان پروتئين را تحت تأثير قرار مي‌دهند و مي‌توانند در عملكرد ژن تأثيرگذار باشند.
