تنوع ژنتيكي در اينترون شماره‌ي 1 ژن هورمون رشد در مرغ‌هاي بومي نژاد مرندي

Genetic diversity in intron 1 of cGH gene in the indigenous chicken of Marandi breed

هورمون رشد مرغ­ها بر رشد و نمو جوجه­ ها، توليد تخم‌مرغ، تيپ بدن، كنترل اشتها، توليد مثل و پاسخ سيستم ايمني بدن تأثير دارد. بسياري از مطالعات نشان داده‌اند كه ژن هورمون رشد يك ژن كانديد براي صفات توليدي مرغ­ها هست. از چندشكلي‌هاي اين ژن مي­توان در بهبود توليد، تجزيه و تحليل فيلوژنتيكي و برنامه­ هاي انتخاب به كمك نشان­گر استفاده كرد. در اين پژوهش چندشكلي‌هاي جايگاه ژني اينترون شماره­ي 1 ژن هورمون رشد در مرغ­هاي بومي نژاد مرندي با استفاده از تكنيك PCR-RFLP مورد بررسي قرار گرفت. در مجموع 100 قطعه مرغ انتخاب و براي شناسايي جهش در اين جايگاه ژني (776 جفت بازي) از آنزيم برشي MspI استفاده شد. پنج ژنوتيپ مختلف شناسايي شد و در كل جمعيت براي سه آلل A1، A2 وA3 به ترتيب فراواني­هاي 24، 4 و 73 درصد برآورد شد. ژنوتيپ A3A3 با بيش­ترين فراواني (50/0) و ژنوتيپ­هاي A1A1 و A1A2 با كم­ترين فراواني (02/0) مشاهده شدند. در كل جمعيت، شاخص اطلاعات شانون و شاخص تثبيت به ترتيب 69/0 و 16/0- محاسبه شدند. بر اساس آزمون كاي اسكور، جمعيت مرغ­هاي بومي نژاد مرندي براي اين جايگاه ژني داراي تعادل هاردي و واينبرگ بود. با توجه چندشكلي زياد اين جايگاه ژني، مي­توان بعد از تعيين ژنوتيپ و عملكرد هر يك از ژنوتيپ­ها در توليد صفات اقتصادي، از اين جايگاه ژني در مرغ­هاي بومي نژاد مرندي به عنوان يك نشان­گر در برنامه ­هاي انتخاب و اصلاح نژاد ژنتيكي جهت بهبود صفات اقتصادي مرتبط با هورمون رشد بهره برد.

The growth hormone of chickens affects the growth and development of chickens, egg production, body type, appetite control, reproduction, and response of body immune system. Several studies have shown that the growth hormone gene is a candidate gene for chicken economic traits. The polymorphisms of this gene can be used to improve of production, phylogenetic analysis and marker assisted selection programs. In this study, allelic polymorphism in intron 1 of growth hormone (cGH) gene in the Marandi indigenous chicken examined using PCR-RFLP technique. A total of 100 birds were selected and for detection of mutation in intron 1 of cGH gene (776 bp), the PCR products were digested by MspI restriction enzyme. The results showed that the five genotypes and three of the A1, A2 and A3 alleles with frequency of 24, 4 and 73 percent respectively, identified. The A3A3 genotype had the highest (0.50) and the lowest (0.02) frequency was found for A1A1 and A1A2 genotypes. In the total population, Shannon's information index and Fixation index 0.69 and -0.16 respectively, calculated. According to the Chi-square test, the Marandi indigenous chickens had a Hardy-Weinberg equilibrium for this locus. Considering the high polymorphism of this locus in Marandi indigenous chickens can after determining the genotype and the performance of each genotype in the production of economic traits be used as a marker in genetic selection and breeding programs to improve the economic traits associated with growth hormone.