مقايسه كارايي نشانگرهاي RAPD وSCoT در تعيين تنوع ژنتيكي ارقام آنتوريوم (Anthurium andreanum) و تعيين روابط ژنتيكي بين آنها

Comparison of the Performance of SCoT and RAPD Markers for Study of Genetic Diversity and Relationships of Anthurium (Anthurium andreanum) Cultivars

بررسي تنوع ژنتيكي براي انجام برنامه­ هاي اصلاحي ضروري مي­ باشد. به­منظور بررسي تنوع ژنتيكي 10 رقم آنتوريومA. andreanum از هفت نشانگر SCoT و 40 نشانگر RAPDاستفاده شد كه در اين مجموعه 22 نشانگر RAPD و تمامي نشانگر­هاي SCoT چند شكلي نشان دادند. ماتريس فاصله ژنتيكي در محدوده اي بين 01/0 تا 37/0 براي نشانگر RAPD و بين 02/0 تا 52/0 براي نشانگر SCoT محاسبه گرديد. درصد چند شكلي نشانگرهاي RAPD و نشانگر SCoT، 100 درصد برآورد گرديد كه تقريباً مشابه بودند. به منظور بررسي روابط ژنتيكي از تجزيه خوشه­اي با روش Neighbor-Joining و با استفاده از نرم ­افزار Splits tree انجام شد. نشانگرهاي RAPD و SCoT ارقام را به سه گروه تقسيم­بندي نمودند. نتايج تحقيق حاضر نشان داد كه نشانگر SCoT نسبت به نشانگر RAPD با وضوح و تفكيك ­پذيري بالايي در شناسايي اطلاعات ژنومي دارد. اين اولين گزارش آناليز تنوع ژنتيكي آنتوريوم با استفاده از نشانگر SCoT بود. در مجموع، نتايج نشان داد كه اين نشانگرها اطلاعات سودمندي را براي محافظت منابع ژرم­پلاسم آنتوريوم فراهم مي­ كنند و همچنين براي برنامه­ هاي اصلاح نباتات مفيد مي ­باشند.

Survey of genetic diversity is essential for breeding program. The genetic diversity of A. andreanum, 10 cultivars were analyzed using seven Start Codon Targeted (SCoT) and 40 RAPD markers in which 22 RAPD markers and all of SCoT marker produced polymorphic bands. Matrix genetic distance ranged from 0.01 to 0.37 for RAPD and from 0.02 to 0.52 for SCoT marker analysis. Polymorphism percentage generated by SCoT markers (100%) was similar to RAPD markers. In order to determine genetic relationships, cluster analysis was performed using Neighbor-joining with Splits tree software. Cluster analysis for RAPD and SCoT markers revealed that cultivars were grouped in three clusters. Results from the present study revealed the superiority of SCoT over RAPD markers due to their high resolution and high variability in detection of genomic information. This is the first report of using SCoT marker for genetic diversity analysis in anthorium. Overall, results showed that these markers provide useful information to protect A. andreanum germplasm resources and also useful for breeding programs.