مقايسه تنوع DNA كلروپلاستي برخي ژنوتيپ‌هاي سيب ايراني، ارقام تجاري و برخي پايه‌هاي متداول

Comparison of Chloroplast DNA Diversity in Some Iranian Apple Genotypes, Commercial Cultivars and Rootstocks

DNA كلروپلاستي 64 نمونه سيب (.spp Malus) (54 ژنوتيپ بومي ايران، پنج رقم تجاري و پنج پايه) براي مشخص كردن هاپلوتايپ‌هاي آنها با كاربرد روش واكنش زنجيره‌اي پلي‌مراز-تفاوت طول قطعات حاصل از هضم (PCR-RFLP) بررسي شد. تقريبا 4320 bp از ژنوم كلروپلاست با كاربرد دو جفت آغازگر عمومي كلروپلاست و دو آنزيم برشي محدودگر (MseI و EcoRI) بررسي گرديد. تمام جهش‌هاي شناسايي شده، حذف-اضافه در محدوده bp 40- 10 بودند. تركيب تمام جهش‌ها، شش هاپلوتايپ (H1, H2, H3, H4, H5, H6) را در نمونه‌هاي مورد بررسي معرفي نمود. مشخص شد كه پايه سيب بومي رقم گمي آلماسي هاپلوتايپ اختصاصي خود را دارا بوده و از تمامي نمونه‌هاي مورد بررسي منطقه خود (آذربايجان) متفاوت است. اطلاعات تنوع DNA كلروپلاستي مي‌تواند براي مطالعات فيلوژنتيكي در اين گياه به كار رود و چند شكلي‌هاي مشخص شده در ژنوم سيتوپلاسمي با روش PCR-RFLP مي‌تواند به درك وراثت مادري سيب كمك كند.

The chloroplastic DNA of 64 accessions of apple (Malus spp.) (54 Iranian genotypes, five commercial cultivars and five rootstocks) were analyzed to reveal their haplotypes by using Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) method. Approximately 4320 bp of the chloroplast genome was analyzed, by using two chloroplast universal primer pairs and two restriction enzymes (EcoRI and MseI). All the mutations detected were insertion-deletions been in the range between 10-40 bp. The combination of all the mutations resulted to six haplotypes (H1, H2, H3, H4, H5 and H6) in the studied apple accessions. It was defined that the Iranian apple rootstock 'Gami-Almasi' had a specific haplotype form all the other studied accessions. It was approved that cpDNA diversity data can be considered for phylogenetic studies in this plant and the polymorphism determined in cytoplasmic genome by PCR-RFLP method can help to understand the maternal inheritance in apple.