بررسي رابطه فيلوژنتيك تعدادي از گونه‌هاي وحشي بادام ايران بـا بهره‌گيري از تـوالي‌هاي ناحيه ITS ريبوزمي هسته و trnL كلروپلاستي

Study on Phylogenetic Relationship among some of Iranian Wild Almond Species using Sequences of ITS1-5.8S rDNA-ITS2 Region and Chloroplastic trnL

رابطه فيلوژنتيك بين 12 گونه وحشي Prunus، يك رقم زراعي بادام و يك رقم هلو، با استفاده از توالي‌‌هاي ناحيه ITS1-5.8S rDNA-ITS2 هسته و ناحيه DNA trnL كلروپلاستي و با روش‌‌هاي حداكثر شباهت و نزديك‌ترين همسايگي مورد ارزيابي قرار گرفت. نتايج حاصل از داده‌‌هاي ITS در اين پژوهش تنها توانست گونه‌هاي مورد مطالعه Prunus را به دو گروه تقسيم كند اما در تفكيك بخش‌ها از يكديگر كارايي لازم را نداشت. گونه P. tenella نسبت به ساير گونه‌‌هاي مورد مطالعه، در فاصلۀ ژنتيكي دورتري قرار گرفت و به نظر مي‌رسد اين گونه به Amygdalus تعلق ندارد. همچنين با استفاده از داده‌‌هاي ITS مي‌توان گزارش نمود، Prunus مونوفيلتيك مي‌‌باشد. فواصل ژنتيكي براي هرجفت از گونه‌‌ها مشخص شد و ميانگين فاصلۀ ژنتيكي در بين گونه‌‌ها تنها كمترين فاصلۀ ژنتيكي را در داخل جنس نشان مي‌‌دهد. بر اساس نتايج اين تحقيق مي‌‌توان Prunus را بصورت تك جنس گزارش نمود و با توجه به شباهت بسيار زياد ناحيۀ trnL در گونه‌‌هاي وحشي بادام، احتمالاً جد مادري Prunus يكي بوده و trnL نشانگر خوبي براي جداسازي گونه‌‌هاي موجود در بادام نيست.

Phylogenetic relations among 12 wild species of almonds, one cultivated almond and one species of peach were investigated by using of ITS1-5.8S rDNA-ITS2 sequences and trnL region of chloroplast DNA. To do this, maximum-parsimony and neighbor joining analysis adopted. Results of ITS data showed that studied species of Prunus only divided in two groups but incapable to separate different sections. P. tenella showed more diverse genetic distance in compare to other studied species and it seems that this species does not belong to Amygdalus. Also, by using the ITS data it can be reported that Prunus is monophyletic. In this research, the genetic distances for each pair of species were determined and the average genetic distance between species shows only the lowest genetic distance within the genus. Therefore, Prunus is a single genus. Regarding its high similarity of trnL region in wild almond species, it can be reported that maternal ancestor of Prunus is the same and trnL is not optimum marker to separate species of almond.