بررسي ارتباط چندشكلي اگزون 1 و اينترون 2 ژن آلفالاكتالبومين با صفات توليد شير در گاوميش بومي استان آذربايجان شرقي با استفاده از تكنيك PCR-SSCP

Investigation of polymorphism of alpha-lactalbumin gene in exon 1 and intron 2 and its association with milk production traits in buffaloes of East Azarbaijan province by PCR‌–SSCP‌ technique.

صفات توليد شير و تركيبات آن جز صفات كمي و چند ژني مي­باشند و تحت تأثير تعداد زيادي ژن قرار دارند. اين تحقيق به منظور تعيين چندشكلي ژن آلفالاكتالبومين و ارتباط آن با صفات توليد شير در گاوميش بومي استان آذربايجان شرقي با استفاده از تكنيك PCR-SSCP انجام شد. بدين منظور از تعداد 150 رأس گاوميش استان آذربايجان شرقي نمونه­ي شير تهيه و استخراج DNA نمونه­ها از شير به روش پروناز صورت گرفت. بعد از انجام مراحل استخراج DNA، واكنش زنجيره­اي پليمراز (PCR) جهت تكثير يك قطعه 392 جفت بازي از اگزون 1 و اينترون 2 ژن آلفالاكتالبومين با استفاده از يك جفت آغازگر اختصاصي انجام گرفت. براي تعيين چندشكلي نمونه‌ها، الكتروفورز محصولات PCR پس از تك رشته شدن قطعات (روش چندشكلي فضايي رشته­هاي منفرد مبتني بر واكنش زنجيره­اي پلي مراز) و الكتروفورز روي ژل آكريلاميد و رنگ‌آميزي ژل به روش نيترات نقره انجام شد. الگوهاي ژنوتيپي 1، 2 و 3 به ترتيب با فراواني 5/87، 71/10، 78/1 مشاهده شد. آناليز آماري نشان داد بين ژنوتيپ­ها و صفات توليد شير، درصد پروتئين، درصد چربي و لاكتوز شير ارتباط معني­دار وجود ندارد. بر اساس نتايج اين تحقيق انتخاب براساس چند شكلي ژن آلفالاكتالبومين نمي­تواند در بهبود ژنتيكي صفات توليد و تركيبات شير در گاوميش­هاي نژاد آذري مؤثر باشد.

Milk production traits and its components belong to quantitative and polygenic traits and affected by many genes. This study was conducted to determine the polymorphism in alpha-lactalbumin gene and its association with milk production traits using PCR-SSCP method in Eastern Azarbaijan native buffaloes. Milk samples were collected from 150 buffaloes of Eastern Azarbaijan province and then DNA samples were extracted using pronase method. After DNA extraction specific primers used for amplification of 392 bp fragment of exon 1 and intron 2 alpha-lactalbumin gene. To identify the polymorphism, PCR products were electrophoresed on polyacrylamide gel (single strand conformation polymorphism method) and stained with silver nitrate method. The frequency of the 1, 2 and 3 genotypic patterns were 87.5%, 10.71% and 1.78% respectively. The statistical analysis indicated that the effect of genotypes on milk production, lactose, fat percentage and protein percentage had no significant effect. Based on current results, the analysis of alpha-lactalbumin gene polymorphism cannot be used for improving milk yield and composition of buffalo in Azari population.