شناسايي فيلوژنتيكي باكتري‌هاي اندوفيت جداشده از ريشه بادمجان و بررسي توان آنتاگونيستي آن‌ها

Phylogenetic characterization endophytic bacteria isolated from egg plant root with antagonistic ability

باكتري‌هاي اندوفيت با توانائي توليد تركيبات آنتاگونيست، قادر به كنترل بيمارگرهاي گياهي هستند. اين مطالعه به منظور بررسي توانايي توليد تركيبات آنتاگونيستي در باكتري‌هاي اندوفيت بادمجان انجام پذيرفته است. در اين پژوهش باكتري‌هاي اندوفيت از ريشه بادمجان، جداسازي گرديد، سويه‌ها از نظر توليد سيدروفور، هيدروژن سيانيد و آنزيم پروتئاز مورد بررسي قرار گرفتند. 5 جدايه براي مطالعات ژنتيكي انتخاب شد. پس از استخراج DNA ژنومي، از روش PCR به منظور تكثير ژن 16S rDNA استفاده گرديد. به منظور شناسايي دقيق باكتري جداسازي شده، محصول PCR، تعيين توالي و ترادف بازي 16SrDNA BLAST گرديد. تمام باكتري‌هاي جداسازي شده در اين پژوهش قادر به توليد آنزيم پروتئاز بودند. تنها يك سويه‌ قادر به توليد هيدروژن سيانيد بود. نتايج آزمون سيدروفور براي دو سويه‌ مثبت بود. نتايج تعيين توالي نشان داد كه باكتري هاي جداسازي شده متعلق به باسيلوس اندوفيتيكوس است كه با سويه تيپ شباهت 100 درصدي دارند و سويه‌هاي جداشده در اين پژوهش، مي‌توانند در افزايش رشد گياه به‌كار روند. از آن‌جا كه كشاورزي پايدار به توانائي حفظ توليد، همراه با استمرار نگه‌داشت منابع و حفظ محيط زيست تاكيد دارد، لذا كاربرد باكتري‌هاي اندوفيت در راستاي اهداف كشاورزي پايدار است و بي شك با شناخت و كشف مكانيزم‌هاي دخيل مي‌توان به اين مهم دست يافت.

Endophytic bacteria are able to control plant pathogens by producing antagonistic compounds. This research was conducted to determine antagonistic ability of bacterial endophytes in egg plant (Solanum melongena L.). In this research endophytic bacteria were isolated from root of eggplant (Solanum melongena L.). Strains were surveyed for siderophore, Hydrogen cyanide and protease tests. 5 isolates were selected for genetic assay. After genomic DNA extraction, 16S rDNA gene was amplified using PCR for precisely bacterial identification. Then, the PCR product was sequenced by BLAST All isolated bacteria were able to produce protease. Only one strain (eg5) was able to produce cyanide hydrogen. The siderophore test was positive for two strains (eg2 and eg4). Based on the 16S rDNA sequence studies, this bacterium belonged to Bacillus endophyticus and indicated 100% similarity to type strain. The endophytic bacteria isolated in this study can be used to promote plant growth. Knowledge about endophytic bacteria- plant interaction can provide effective strategy to develop sustainable agriculture in order to ensure yield improvement without affecting environment.