ارتباط چندشكلي‌هاي ژن FASN با صفات توليدي و توليدمثلي در گاوهاي هلشتاين استان كرمان

Association of polymorphisms of FASN gene with productive and reproductive traits in Iranian Holstein cows of Kerman province

اسيد چرب سنتتاز (FASN)، يك پروتئين چندعاملي است كه سنتز اسيدهاي چرب را انجام مي‌دهد، توسط ژن FASN رمزگذاري مي‌شود و يكي از ژن‌هاي كانديداي عمده شناخته شده است كه نقش اصلي در بازسازي سنتز چربي‌ها در پستانداران ايفا مي‌كند. اين مطالعه به منظور شناسايي چندشكلي‌هاي تك نوكلئوتيدي ژن FASN و كاوش ارتباط آنها با سه صفت اقتصادي مهم شامل توليد شير (M)، فاصله گوساله‌زايي (CI) و نرخ آبستني (CR) در گاوهاي هلشتاين استان كرمان انجام شد. نمونه‌هاي خون كامل مربوط به 38 رأس گاو شيري هلشتاين با ارزش‌هاي اصلاحي برآورد شده بالا و پايين جمع‌آوري شد. DNA ژنومي از نمونه‌هاي خون گاو با استفاده از كيت استخراج DNA ژنومي بر اساس دستورالعمل شركت سازنده استخراج شد. مواد ژنتيكي براي تكثير قطعه ژن انتخابي (به طول 750 جفت باز از اگزون 37 تا 39) با واكنش زنجيره‌اي پلي‌مراز استفاده شد. متعاقباً تمام قطعات تكثيري مستقيماً براي توالي‌يابي استفاده شدند. در ادامه تجزيه توالي‌هاي هدف با رگرسيون چندگانه اثرات متوسط جايگزيني آللي بر صفات توليد شير، فاصله گوساله‌زايي و نرخ آبستني 58 نشانگر SNP را نمايان ساخت كه از بين آنها هشت SNPs به طور كلي با صفات توليدي و توليد مثلي مرتبط بودند. توليد شير، فاصله گوساله‌زايي و نرخ آبستني به ترتيب با سه (g.16593A>G, g.16670C>A, g.16776C>T)، سه (g.16524G,C,T>A, g.16830G,C,T>A, g.16833A,T>G) و دو (g.16594A,C>G and g.16811A,T>G) SNPs ارتباط معني‌دار داشتند (05/0P<). ارتباط چند‌شكلي جايگاه ژن FASN با صفات مي‌تواند به‌عنوان نشانگر مولكولي در تعيين شايستگي ژنتيكي دام‌ها و همچنين راهبردهاي اصلاح نژادي در جمعيت گاوهاي هلشتاين مورد استفاده قرار گيرد.

Fatty acid synthase (FASN), a multifunctional protein that carries out the synthesis of fatty acids, is coded by FASN gene which is known as major candied gene and plays a central role in de novo lipogenesis in mammals. This study was conducted to detect single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the FASN gene and explore their relationships with three economically important traits including milk production (M), calving interval (CI) and conception rate (CR) in Holstein cows of Kerman province. The whole blood samples corresponding to the 38 Holstein cows with high and low estimate breeding values were collected. Genomic DNA was extracted from blood samples of the cows using a genomic DNA kit according to the manufacturer’s instructions. The genetic material was used for polymerase chain reaction amplification of selected gene fragments (750bp length from exon 37 to 39). All of PCR products were subsequently used directly for sequencing. Analysis of the target sequence followed by multiple regression of average allele substitution effects on M, CI, and CR traits revealed 58 SNP markers, among which 8 SNPs were totally associated with productive and reproductive traits. (M), (CI) and (CR) were affected by three (g.16593A>G, g.16670C>A and g.16776C>T), three (g.16524G,C,T>A, g.16830G,C,T>A, g.16833A,T>G) and two (g.16594A,C>G and g.16811A,T>G) SNPs respectively (P<0.05). Association between polymorphism in FASN gene and traits could be used as molecular markers for determination of animal's genetic potential as well as breeding strategies in Holstein population.