بررسي چندشكلي تعدادي از نشانگرهاي ريزماهواره (Microsatellite) در يك جمعيت از گوسفندان بلوچي

Investigation of Polymorphism of Some Microsatellite Markers in Baluchi Sheep Population

نظر به اهميت حفظ و نگهداري نژادهاي بومي به‌عنوان ذخاير ژنتيكي كشور، نژاد گوسفند بلوچي به‌عنوان پرجمعيت‌ترين نژاد گوسفند ايراني و داشتن شجره قابل‌اطمينان، انتخاب شد. در اين تحقيق با استفاده از 15 نشانگر ريزماهواره (TGLA231, OarVH110, McMA10, McMA1, McM214, McM139 McM63, LSCV38, LSCV36, KD101, BMS2721, BMS995, BMS332, BM1815, BM737 ( تنوع ژنتيكي در يك جمعيت از گوسفند بلوچي مورد بررسي قرار گرفت. تعداد 140 رأس دام از ايستگاه عباس‌آباد مشهد به‌صورت تصادفي انتخاب‌ شدند. پس از انجام واكنش‌هاي PCR، جايگاه McM139 به هيچ‌كدام از شرايط بهينه‌سازي تكثير جواب نداد. جايگاه LSCV38 به علت داشتن آلل صفر زياد و عدم وضوح آللي مورد استفاده قرار نگرفت. بقيه جايگاه‌ها در جمعيت مورد مطالعه چند­شكل بودند. تعداد آلل­هاي مشاهده‌شده از 6 آلل در جايگاه‌هاي BM737، BMS332، McMA10 تا 12 آلل در جايگاه McM63 و آلل مؤثر از 3.51 در جايگاه LSCV36 تا 8.66 در جايگاه OarVH110 متغير بودند. بيشترين هتروزايگوسيتي مورد انتظار در جايگاه OarVH110با 12 آلل و به مقدار (890/0) و كمترين آن در جايگاه LSCV36 (718/0) با 7 آلل مشاهده شد. بيشترين محتواي اطلاعاتي چندشكلي (PIC) در جايگاه OarVH110 (873/0) و كمترين مقدار اين معيار در جايگاه LSCV36 (669/0) بود. بيشترين و كمترين مقدار شاخص شانون به ترتيب براي جايگاه OarVH110 (2.21) و LSCV36 (1.47) برآورد شد. با توجه به نتايج، جايگاه‌هاي ريزماهواره مورداستفاده از چندشكلي بالايي در جمعيت گوسفند بلوچي برخوردار بودند و مي‌توان از چندشكلي بالاي آنها در مطالعات بعدي، به‌ويژه براي يافتن جايگاه‌هاي صفات كمي استفاده نمود. وجود آلل­ ها و دامنه آللي جديد در اين نژاد حاكي از تفاوت ساختار جمعيتي آنها در مقايسه با گوسفندان نژاد‌هاي خارجي است.

Due to the importance of conservation and preserving indigenous breeds, Baluchi sheep as the most populous breed of Iranian sheep with reliable pedigree was selected. In this study genetic variations were analyzed with 15 microsatellites markers (BM737, BM1815, BMS332, BMS995, BMS2721, KD101, LSCV36, LSCV38, McM63, McM139, McM214, McMA1, McMA10, OarVH110, TGLA231) in a population of Baluchi sheep. Whole blood samples were randomly collected from 140 sheep at Abbas Abad Breeding Station (Mashhad). After PCR reactions, McM139 locus wasn't amplified and LSCV38 locus was ignored for many null Alleles. Thirteen microsatellites loci were %100 polymorphic. Number of alleles, observed and expected heterozygosity, polymorphic information content (PIC) and Shannon index were calculated. Highest and lowest allele numbers was observed in OarVH110 locus with 12 alleles and 6 alleles in BM737, BMS332, McMA10, respectively. Effective number of allele was between 3.51 (LSCV36) to 8.66 (OarVH110). The highest and the lowest heterozygosity belonged to 0.89 (OarVH110) and 0.71 (LSCV36), respectively. OarVH110 locus indicated the highest PIC (0.873) and LSCV36 locus indicated the lowest PIC (0.669). The highest and lowest Shannon index were belonged to 2.21 (OarVH110) and 0.66 (LSCV36), respectively. These results verify high efficiency of microsatellites marker for screening of population's structure in Iranian native sheep and in future study for QTL mapping. So, presence of new alleles and allele range indicates difference between Baluchi sheep population structure with foreign Sheep breeds.