تنوع ژن 2AHP ويروس برگ بادبزني مو در سطح امينو اسيدي بيشتر از سطح نوكلئوتيدي آن است

Grapevine fanleaf virus 2AHP gene shows more diversity at amino acid level rather than nucleotide level

ويروس برگ باد بزني مو (Grapevine fanleaf virus, GFLV) در تاكستان‌هاي مناطق مختلف دنيا شيوع دارد. علايم ايجاد شده توسط اين ويروس اغلب در سه سندرم برگ بادبزني، موزاييك زرد و رگ نواري تقسيم بندي شده ­اند كه علت تفاوت در ايجاد علايم به تنوع ژنتيكي جدايه‌ها نسبت داده شده ­است. از اين­رو در اين تحقيق تنوع ژنتيكي GFLV 2AHP بويژه در جدايه­­‌هاي همراه با علايم زردي بررسي شد. نمونه‌ها از تاكستان‌هاي بناب، روستاي شيرامين، حسين آباد قزوين و تبريز جمع آوري و ژن 2AHP در 11 جدايه تكثير، همسانه ­سازي و تعيين ترادف شد. اين ژن در سطح نوكلوتيدي و امينواسيدي به ترتيب 27-8/0 و 35-8/0 درصد تنوع داشت كه نشانگر تنوع بيشتر در سطح آمينواسيدي نسبت به اسيدهاي نوكلئيك است. نتايج آزمون نوتركيبي بر وجود نقطه داغ براي نوتركيبي را تاييد نمود. فشار انتخابي اين ژن در تمامي بخش­هاي آن يكسان نبوده به طوري كه انتهاي آميني 2AHP متناظر با نوكلئوتيدهاي 564-408 بيشتر از 1 بود. وجود جهش­ هاي نقطه ­اي كه منجر به تغيير امينواسيدها شده ­اند به همراه نوتركيبي مي­توانند تنوع بيشتر اسيدآمينه ­ها در مقايسه با نوكلئوتيدها را در اين ناحيه ژني توجيه كنند.

Grapevine fanleaf virus 2AHP gene shows more diversity at amino acid level rather than nucleotide level Marziyeh Enteshari, Shaheen Nourinejhad Zarghani *, Sayed Mohsen Nassaj Hosseini Department of Entomology and Plant Pathology, College of Abouraihan, University of Tehran, Iran , sh_nourinejhad@ut.ac.ir Abstract: (871 Views) Grapevine fanleaf virus (GFLV) has been reported from vineyards worldwide. The virus causes different symptoms categorized as three distinct syndromes including fanleaf degeneration, yellow mosaic, and vein banding. These variations in the symptoms can be addressed by analysis of genetic diversity of the virus. The aim of the present study was to estimate genetic diversity of the corresponding 2AHP gene in GFLV isolates especially the ones that are associated with the yellow mosaic syndrome. Accordingly, the grapevine samples were collected from vineyards in Bonab, Shir-Amin, Hossein-Abad, and Tabriz in East Azarbaijan Province of Iran. After amplification of GFLV 2AHP gene from the infected samples via RT-PCR, the products were cloned and sequenced. The sequenced GFLV 2AHP gene from 11 different isolates showed 0.8-27% and 0.8-35 % diversity at nucleotide and amino acid levels, respectively, denoting a higher diversity of 2AHP amino acid sequence than its nucleotide sequence. Likewise, presence of a hot spot for recombination events on 2AHP region was explored by the use of recombination analysis. Moreover, it was found that the selection pressure on 2AHP region is not uniformly distributed so that the ratio (dn/ds) for the N-terminus proximity, between the nucleotides 408-564, was more than one. Therefore, synonymus point mutations as well as recombination events might be reason for this evidence.