مروري بر كاربرد روش‌هاي تايپينگ مولكولي در گونه هاي آسپرژيلوس

A Review on Molecular Typing Methods for Aspergillus Species

اسپورهاي قارچ آسپرژيلوس به طور گسترده‌اي توسط هوا در محيط پراكنده مي‌شوند. به دليل افزايش تعداد بيماران با سيستم ايمني ضعيف عفونت‌هاي ناشي از آسپرژيلوس يك مشكل در حال گسترش در بيمارستان‌ها مي‌باشد. تايپينگ مولكولي گونه‌هاي آسپرژيلوس جدا شده از محيط و ضايعات باليني ديدگاه‌هاي جديدي را در مسائل مهم بهداشت عمومي و اپيدميولوژيك فراهم مي‌كند. انگشت نگاري گونه‌هاي آسپرژيلوس به خصوص فوميگاتوس و فلاووس از نمونه‌هاي تنفسي و از محيط نيازمند تكنيك‌هاي تايپينگ با قدرت تفكيك بالا مي‌باشد. در سال‌هاي اخير، روش‌هاي مولكولي مختلفي براي تايپينگ گونه‌هاي مختلف آسپرژيلوس توصيف شده است. اين روش‌ها از جنبه هاي تكرار پذيري، جابه جايي، و تبادل اطلاعات تايپينگ بسيار مفيد مي‌باشند. علاوه بر امكان‌پذيري عملي، استفاده آسان، قدرت شناسايي بالا، تغييرپذيري و تكرارپذيري در آزمايشگاه و ميان آزمايشگاه‌هاي مختلف و تفسير معتبر و آسان داده‌ها در تكنيك‌هاي مختلف تايپينگ بسيار مهم هستند. روش‌هاي دقيق تايپينگ تا به امروز تايپينگ توالي چندلوكوس (MLST) و تايپينگ مبتني بر ميكروستلايت‌ها مي‌باشند. در اين مطالعه انواع روش‌هاي مولكولي براي آناليز ژنوتايپينگ گونه‌هاي آسپرژيلوس به منظور درك اپيدميولوژي اين قارچ‌هاي پاتوژن فرصت طلب مورد بحث قرار مي‌گيرد.

Conidia of Aspergillus species are widely distributed and ubiquitous in outdoor and hospital environments. There are high numbers of patients with weakened immune systems, therefore Aspergillus infections are increasing in hospitals. Molecular typing of Aspergillus strains obtained from patients and their environment is an important tool for epidemiological and public health studies. Fingerprinting for Aspergillus species especially fumigatus and flavus adjusted from respiratory samples and environment requires high quality typing methods. In recent years several molecular typing methods have been established for different Aspergillus species. These methods are more useful than conventional methods and are of great importance due to being more practically accessible, easy to use, having high ability in diagnosis, repeatable and sensitive to change in one laboratory and between different laboratories, and easy interpretation of data. Today accurate typing methods include Multilocus Sequence Typing (MLST) and micro satellites. In ccurrent review different molecular methods for Aspergillus species genotyping are discussed to obtain a better insight into epidemiology of this pathogen.