تجزيه و تحليل بيوانفورماتيكي ژن هاي pcbAB, pcbC و penDE در سنتز پني سيلين در قارچ ها

Bioinformatics analysis of pcbAB, pcbC and penDE genes in penicillin synthesis at fungi

آنتي­ بيوتيك ­ها از جمله محصولات با ارزشي هستند كه در دنيا در جهت سلامت انسان­ها مصرف مي­شوند. منبع مولد آنتي­ بيوتيك ­ها، ميكروارگانيسم­هايي از جمله قارچ­ها و باكتري­ها مي ­باشند. در مطالعه حاضر، توالي­ هاي DNA مربوط به ژن­هاي دخيل در سنتز آنتي­ بيوتيك ­ها پني­ سيلين (penDE ، pcbC،pcbAB)، در چند جنس از قارچ­ها، از بانك­هاي اطلاعاتي استخراج و توسط نرم افزار MEGA5 خوشه­ بندي شدند. مقايسه توالي­ها در سطوح مختلف، شباهت­ها و تفاوت­هاي قابل­ توجهي نشان دادند كه از آن جمله مي­توان به قرارگرفتن هر كدام از ژن­ها در كلادهاي متفاوت و تشابه توالي در جنس­هاي Penicillium و Aspergilus، شباهت توالي بين گونه ­هاي A. flavus و A. oryzae و همچنين گونه­ هاي P. chrysogenum و P. nalgiovense اشاره نمود. به نظر مي­رسد با توجه به اهميت آنتي­ بيوتيك ­ها، خصوصا آنتي­ بيوتيك ­ پني­ سيلين، اين تفاوت­ها و شباهت­ها مي­تواند كانديدي براي مطالعات بيوانفورماتيكي بعدي باشد.

Antibiotics are valuable components that are being used for human health globally. Fungi, bacteria are such important antibiotic producers. At the recent survey we have collected the DNA sequences of several fungal genera, penicillin antibiotic related genes (penDE, pcbC, pcbAB) from databanks and clustered by MEGA5 software. A sequence comparison represents considerable similarities and differences at several levels, it could be considered as placement of each gene at different clade, sequence similaritiesbetween Penicillium and Aspergillus genera andbetween A. flavus and A. oryzae and also P. chrysogenum and P. nalgiovence. According to the importance of the antibiotics specially penicillin, it seems these similarities and differences could be a best candidate for the subsequent bioinformatics researches.