معرفي فن آوري نوين توالي يابي آر.ان.آ

An introduction to RNA sequencing

امروزه فناوري­ هاي توالي­ يابي با نتايج دقيق و راندمان بالا در علوم زيست شناسي بسيار مورد استفاده قرار مي­گيرند. يكي از روش­هاي نسل بعدي توالي ­يابي، توالي­ يابي آر.ان.آ است كه براي بررسي ترانسكريپتوم از آن استفاده مي­شود. اين روش با به كارگيري فناوري­ هاي توالي­ يابي عميق دي.ان.آ مكمل، سنجش فراواني آر.ان.آ در سطح ژنومي را براي محققين ميسر مي­سازد و ديدگاه ما را در ارتباط با پيچيدگي ژنوم يوكاريوت­ها تغيير مي­دهد. پيشرفت­هاي اخير در روش­هاي توالي­ يابي آر.ان.آ، خصوصيات كامل­تري را از رونوشت­هاي آر.ان.آ در مقايسه با ساير روش­ها نشان مي­دهد. اين پيشرفت­ها شامل بهبود نقشه­ برداري جايگاه­هاي شروع رونويسي، سنجش بيان اختصاصي يك رشته، بررسي اتصالات ژني و تشخيص پيرايش­ هاي فرعي و تركيب ايزوفرم­ها مي‍باشند. پيشرفت­هاي مداوم در اين فناوري، امكان توالي­ يابي مستقيم آر.ان.آ و دست­يابي به توالي­ هاي مربوط به مولكول­هاي آر.ان.آ با فراواني پايين را نيز فراهم نموده است. در اين مقاله مروري، به معرفي روش توالي­ يابي آر.ان.آ و كاربردهاي آن پرداخته شده و به برخي پيشرفت­ هاي آن كه به بسياري از محدوديت­ هاي ساير روش­ها غلبه مي­كند، اشاره خواهد شد.

High-throughput sequencing technologies are now in common use in biology. RNA-seq is one of the next generation sequencing that applies for transcriptome profiling. This method with deep sequencing of complementary DNA allows researchers to measure RNA abundance on a genome -wide scale and alter our view of the extent and complexity of eukaryotic transcriptomes. Recently, several developments in RNA-seq methods have provided an even more complete characterization of RNA transcripts than other methods. These developments include improvements in transcription start site mapping, strand-specific measurements, gene fusion detection and detection of alternative splicing events and isoforms. Ongoing developments of this technology get possible of direct RNA sequencing and profiling low-quantity RNA samples. In this review article will be introduced RNA-seq technology and implied some developments that overcome limitation of other methods.