طراحي بيوانفورماتيكي پروتئين گيرنده IFN-α/βنوتركيببراي مقابله با اثرات آنتاگونيستي پروتئين VP35ويروس ابولا (Ebola)

In silico design of recombinant IFNα/β receptor protein to combat antagonistic effects of Ebola VP35 protein

پروتئين VP35 ويروس ابولا يكي از مهمترين تركيبات بيماري‌زايي واكنش كننده با سلول‌هاي ميزبان است كه با پاسخ ايمني‌زايي طبيعي سلول‌هاي بدن تداخل ايجاد مي‌كند.VP35 اين كار را با توانايي آنتاگونيستي خود كه مانع از فعاليت فاكتور تنظيمي اينترفرون به نام پروتئين فاكتور 3 (IRF-3) در سلول‌هاي آلوده به ويروس مي‌شود انجام مي‌دهد و القا بيان ژن‌هاي ضد ويروسي را مختل مي‌كند. در مطالعه حاضر ما در فضاي مجازي پروتئين گيرنده IFNα/β نوتركيبي را طراحي كرده‌ايم كه مي‌تواند توسط سلول‌هاي ميزبان به داخل سيستم گردش خون ترشح شود. زماني كه بدن در معرض ويروس ابولا قرار مي‌گيرد پروتئين نوتركيب مي‌تواند با پروتئين VP35 ويروس برهمكنش داشته و اثرات آنتاگونيستي آن را بر روي پروتئين IRF-3 خنثي كند. با استفاده از نرم‌افزارهاي بيوانفورماتيكي ميزان توانايي پروتئين طراحي شده براي برهمكنش با پروتئين ويروس و خنثي‌سازي اثرات آن مورد ارزيابي قرار گرفت. با اين وجود براي بدست آوردن نتايج بهتر و استفاده از پروتئين طراحي شده به عنوان يك پتانسيل درماني بايد بررسي‌هاي بيشتري در آينده در هر دو شرايط in vitro و in vivo انجام شود.

The VP35 protein in Ebola virus is one of the main pathogenic components interacting to host cells and interferes with natural cellular immune responses. This is done by antagonistic potential of the viral VP35 protein which inhibits interferon regulatory factor 3 (IRF-3) protein in the infected cells and then induction of antiviral genes expression are disrupted. In the present in silico study, we have designed a novel recombinant IFNα/β receptor protein which can be secreted out by host cells and circulate in blood stream. When the body encounters the virus, the recombinant protein can binds to VP35 and inhibit its antagonistic effect on IRF-3 proteins. Evaluations made by bioinformatics softwares revealed that the novel recombinant protein show promise for ameliorating the virulence of Ebola. But the obtained results should be investigated in vitro and in vivo for further evaluation and possible approval as a therapeutic strategy.