مقايسه كارآيي اتيديوم مونوآزيد (EMA) و پروپيديوم مونوآزيد (PMA)در شمارش سلول هاي زنده پاتوژن به روش PCR زمان واقعي در سيستم هاي مدل غذايي

Comparing Efficacy of Ethidium Monoazide (EMA) and Propidium Monoazide (PMA) qPCR in Live Pathogen Quantifying by Real-Time PCR in Food Model Systems

تكنيك PCR علاوه بر DNA سلول هاي زنده، سلول هاي مرده را نيز شمارش مي كند و اين امر قضاوت در مورد كيفيت ميكربي نمونه هاي غذايي را دچار مشكل مي نمايد. هدف اين مطالعه مقايسه تكنيك هاي اتيديوم مونوآزيدqPCR- و پروپيديوم مونوآزيد-qPCR در شمارش سلول هاي پاتوژن (اشرشياكلي، استافيلوكوكوس ارئوس، انتروكوكوس فيكاليس و ليستريامونوسيتوجنس) در نمونه هاي شير كم چرب و پرچرب، پنير لاكتيكي (كم چرب) و پنير پروسس (پرچرب) بود. نسبت‌هاي مختلف از پاتوژن ‌هاي زنده و كشته شده توسط حرارت به نمونه هاي غذايي تلقيح گرديد. پس از جداسازي پلت باكتريايي و تيمار باEMA و PMA ، PCR كمي انجام شد. آناليز واريانس يك طرفه و آزمون توكي جهت تحليل داده ها بكار رفت. در نمونه شير كم چرب، طي تيمار با EMA، كاهش 18، 20، 23 و 30 درصدي در شمارش اشرشياكلي، استافيلوكوكوس اورئوس، انتروكوكوس فكاليس و ليستريامونوسيتوجنس در مقايسه با كشت معمولي مشاهده شد. همچنين در تيمار با PMA در همين نمونه كاهش 6، 3، 8 و 12 درصدي در شمارش اشرشياكلي، استافيلوكوكوس اورئوس، انتروكوكوس فكاليس و ليستريامونوسيتوجنس به دست آمد. در نمونه هاي غذايي پرچرب مانند پنير پروسس در تيمار با EMA، كاهش 20، 27، 30 و 25 درصدي و در تيمار با PMA كاهش 9، 6، 10 و 5 درصدي در تعداد، به ترتيب، اشرشياكلي، استافيلوكوكوس اورئوس، انتروكوكوس فكاليس و ليستريامونوسيتوجنس مشاهده گرديد. درجه بازداري EMA و PMA از توليد سيگنال در باكتري هاي مختلف متفاوت بود و درصد چربي نمونه ها تاثير معناداري (05/0

PCR quantifies dead cells beside live cells and this makes the judgment of microbial quality of food samples complicated. The objective of this study was comparing the efficacy of ethidium monoazide-qPCR and propidium monoazide-qPCR in quantifying live pathogen cells (E.coli, Staphylococcus aureus, Enterococcus fecalis and Listeria monocyogenes) by real time PCR, in low-fat and high-fat milk, lactic cheese (low-fat) and processed cheese (high-fat). Different proportions of live and heat killed pathogen cells were inoculated into food samples. After separating bacterial pellets, EMA and PMA treatments qPCR was conducted. One-way ANOVA followed by Turkey’s Multiple Comparison tests were applied to analyze the data. In low-fat milk, EMA treatment resulted in 18, 20, 23 and 30% decrease in cell count of E.coli, S.aureus, E. fecalis and L. monocyogenes, respectively, compared to conventional culturing. Also, following treatment by PMA, 6, 3, 8 and 12% decrease in cell count was obtained for E.coli, S.aureus, E. fecalis and L. monocyogenes, respectively, compared to conventional culturing. In high-fat samples as processed cheese, a reduction of 20, 27, 30 and 25% in EMA treatment and 9, 6, 5 and 10% in PMA treatment was observed in cell count of E.coli, S.aureus, E. fecalis and L. monocyogenes , respectively. The inhibitory potential of EMA and PMA against signal emission was variable in different bacterial species and the fat content of the samples exerted no significant effect (p>0.05) on PMA and EMA functionality.