پلي مورفيسم تك نوكلئوتيدي بخشي از ژن GH و ارتباط آن با صفات لاشه در گوسفندان افشاري و افشاري-برولا مرينو

Single Nucleotide Polymorphism in part of GH Gene and Its Association with Carcass Traits in Afshari and Afshari-Booroola Merino sheep

هورمون رشد يكي از عوامل اصلي تأثيرگذار بر رشد حيوانات است. وجود آلل هاي مختلف اين ژن ممكن است تأثيرات فنوتيپي متفاوتي داشته باشند. هدف مطالعه حاضر، شناسايي آلل هاي اين ژن در نواحي اگزون 5 و بخشي از ناحيه 3′ UTR بود. براي اين منظور تعداد 133 رأس بره از يك گله و در سن تقريبا يكسان در سه گروه افشاري خالص، آميخته افشاري- برولامرينو نسل F2 و F5 مورد استفاده قرار گرفتند. قبل از كشتار از اين دامها نمونه خون تهيه شد. پس از انجام اندازه-گيري‌هاي فنوتيپي بر روي دام زنده، تعداد 85 رأس از اين دام‌ها كشتار شدند. پس از كشتار، وزن لاشه اندازه‌گيري شد و بعد از 24 ساعت ماندن لاشه در سردخانه، وزن ران، سردست، قلوه‌گاه، دنبه و ضايعات اندازه‌گيري شد. برآورد صفات لاشه در دام‌هاي كشتار نشده، با استفاده از ضرايب رگرسيوني انجام شد. از نمونه‌هاي خون به روش فنل-كلروفرم DNA استخراج گرديد. سپس با استفاده از پرايمرهاي طراحي شده، قطعه موردنظر تكثير و مستقما توالي‌يابي گرديد. پس از آناليز توالي‌ها، ارتباط ژنوتيپ‌ها با صفات لاشه مورد بررسي قرار گرفت. نتايج نشان داد جايگاه نوكلئوتيدي 2846 داراي دو ژنوتيپ TT و TC بود كه بر اندازه طول بدن دام در دام‌هاي افشاري خالص و F5 تأثير داشت. در جايگاه نوكلئوتيدي 2882 يك نوكلئوتيد در برخي از دام‌ها به توالي اضافه شده بود كه اين ژنوتيپ فقط در دام‌هاي F2 با ضايعات(چربي) لاشه ارتباط داشت. اين نتايج نشان مي‌دهد كه از تغييرات نوكلئوتيدي مشاهده شده در صورت تائيد در ديگر بررسي هاي مربوطه مي‌تواند در برنامه انتخاب دام به كمك ماركرها مورد استفاده قرار گيرد.

Growth hormone is one of the main factors affecting the growth of animals. Dِِifferent alleles of this gene, may lead to different phenotypic effects. The aim of this study was to identify alleles of this gene in exon 5 and part of the 3′downstream area. For this purpose, 133 lambs from a flock and ultimately at the same age in three groups of Afshari pure breed and F2 and F5 crosses of Afshari- Booroola Merino were used. After taking Blood samples and recording the phenotypic measurements on live animals, 85 lambs were slaughtered. Afterward, carcass weight was measured. After 24 hours storing the carcasses in the cold room the weight of thigh, shoulder, neck, fat tail right side of carcass and waste was measured. Regression coefficient analyses were used to estimate carcass traits of those animals that were not slaughtered. DNA was extracted by phenol-chloroform procedures from blood samples. Then, using designed primers, the desired fragment was amplified and directly sequenced. Afterward, by analyzing of sequences, association of genotypes with carcass traits were evaluated. The results showed that in the nucleotide site of 2846 there were two genotypes, TT and TC, affecting the length of the body in Afshari pure breed and F5 crosses. In position 2882 sequence of the gene, a nucleotide was inserted in some animals and this insertion only in F2 crosses was associated with waste (carcass fat). Our results on the observed variations in case be proved by further evaluations, it can be used in marker assisted selection program in sheep breeding.