ارزيابي تنوع ژنتيكي برخي از جمعيت‌هاي گياه خارمريم با استفاده از نشانگر‌ مولكولي

Evaluation of genetic diversity in several populations of medicinal Milk thistle using molecular marker

خارمريم از خانواده كاسني، يكي از گياهان دارويي با خصوصيات دارويي منحصر به فرد در درمان بيماري‌هاي كبد است كه در بسياري از مناطق ايران رشد مي‌كند. در اين مطالعه از نشانگر SCoT براي مطالعه تنوع ژنتيكي 38 نمونه خارمريم از مناطق مختلف استان‌هاي خوزستان و ايلام استفاده شد. در مجموع 146 قطعه تكثير شد و 69% از آنها چند شكلي بودند. بيشترين تعداد قطعات تكثير شده مربوط به آغازگر SCoT10 با 12 قطعه و كمترين تعداد قطعات تكثير شده مربوط به آغازگرهاي SCoT22، SCoT47 و SCoT55 با شش قطعه بود. متوسط تعداد باند براي هر آغازگر 8/58 و متوسط باندهاي چندشكلي 6 بود. محتوي اطلاعات چندشكلي و قدرت تفكيك (PICD) بين 0/089 در آغازگر SCoT22 و 0/219 در آغازگر SCoT31 با ميانگين 0/151 متغير بود. ماتريس تشابه با استفاده از ضريب جاكارد، تجزيه خوشه‌اي با الگوريتم UPGMA و تجزيه به مختصات اصلي انجام شد. براساس تجزيه خوشه‌اي، نمونه‌هاي خار‌مريم به 3 گروه تقسيم شدند. براساس ماتريس تشابه، كمترين شباهت (0/44) مربوط به دو نمونه ايوان و بهبهان، و همچنين بيشترين شباهت (0/92) بين دو نمونه از ميان‌آب از يك منطقه جغرافيايي مشابه بود. تجزيه واريانس مولكولي (AMOVA) نشان داد كه سطح بيشتري از تنوع به درون جمعيت‌ها (89 درصد) تعلق داشت، درحالي كه تنها 11 درصد تنوع در بين جمعيت‌ها مشاهده شد. در نهايت نتايج نشان‌دهنده تنوع زياد در بين ژنوتيپ‌هاي مورد مطالعه بود.

Milk thistle (Silybum marianum L.) belongs to Compositae family, is a medicinal plant with unique pharmaceutical properties for treating liver diseases and grows throughout various geographical areas in Iran. In this study, SCoT markers were employed to investigate the genetic diversity of 36 samples of milk thistle from different geographical regions of Ilam and Khuzestan provinces. A total of 146 fragments were amplified and 69% of them were polymorphic. The most amplified fragments were related to the SCoT10 with 12 fragments and the lowest amplified bands were related to the SCoT22, SCoT47 and SCoT55 with 6 fragments. Mean number of amplified bands for primers was 8.58, while the mean number of polymorphic bands was 6.00. Polymorphic information content and discrimination power (PICD) varied between 0.089 in SCoT22 and 0.219 in SCoT31 with an average of 0.151. Similarity matrix was generated using the Jaccard coefficient, Cluster analysis was carried out by UPGMA algorithm and Principle Coordinate Analysis. According to cluster analysis, Milk thistle samples were divided into 3 groups. Based upon similarity matrix, the lowest similarity (0.44) was found for two samples from Eyvan and Behbahan and also the highest similarity (0.92) found between two samples from Mian-Ab within the same geographical region. Analysis of molecular variance (AMOVA) showed that a larger proportion of genetic variation (89%) belonged to within the populations, while only a small proportion (11%) observed among the studied populations. The results finally indicated high genetic diversity among the studied genotypes.