استفاده از نشانگرهاي RAPD براي شناسايي تغييرات ژنتيكي در مرغان ايستگاه تكثير و اصلاح نژاد مرغ بومي مازندران

Use of Random Amplified Polymorphic DNA(RAPD) Markers to Detect GeneticVariation of Native Fowls in Mazandaran Native Fowls Breeding Station

به منظور شناسايي واريانس ژنتيكي مرغان ايستگاه تكثير و اصلاح نژاد مرغ بومي مازندران با استفاده از نشانگرهاي RAPD نمونه‌هاي خون از 100 قطعه مرغ و خروس تهيه و DNA آنها به روش بهينه يافته نمكي (Salting out) استخراج گرديد. از 20 آغازگر مورد استفاده در اين تحقيق 14 آغازگر توانستند باندهاي مناسب و قابل قبولي را تكثير نمايند. محصولات واكنش زنجيره‌اي پلي مراز (PCR) با استفاده از ژل آگارز 5/1 % الكتروفورز شد. با استفاده از اين تعداد آغازگر140 باند شناسايي كه از اين تعداد 63 باند چند شكل و 77 باند يك شكل شناسايي شد. تعداد باندهاي شناسايي شده به ازاي هر آغازگر بين 16-4 با دامنه تغييرات 2100- 200 جفت باز بوده ميزان چند شكلي بدست آمده در اين جمعيت 45% بوده است بيشترين درصد چند شكلي مربوط به آغازگر PR-9 با 72% و كمترين درصد چند شكلي مربوط به آغازگر PR-14 با 16% نشانداده شد. فراواني اشتراك باندي (BSF‌) براي هر آغازگر محاسبه و در دامنه 96/0-79/0 بوده است. تشابه ژنتيكي درون جمعيتي (WGS) بعنوان متوسط فراواني اشتراك باندي و واريانس ژنتيكي محاسبه و مقدار آنها به ترتيب برابر 0/89 و 0/11 برآورد شد. در نتيجه سطح بالاي چند شكلي بعد از ده نسل انتخاب مي‌تواند مبين ارزيابي درست ژنتيكي‌‌‌، راه‌كارهاي انتخاب مناسب و هم‌چنين اندازه مؤثر جمعيت مي‌باشد.

In order to detect genetic variation of native fowls in Mazandaran native Fowls breeding station, blood samples were collected from 100 male and female of birds (1:11). The DNA of the blood samples was extracted according to an optimized salting out protocol. The extracted DNA was amplified through polymerase chain reaction (PCR). Of the twenty random primers (10 mer) were used in this study, fourteen yielded satisfactory PCR. The total 63 polymorphic and 77 monomorphic bands were detected for the 14 primers. The number of bands displayed for each primer ranged from 4 to 16 with 200-2100 base pairs. The highest and lowest percentages of polymorphism band were observed for primer 9 (72%) and primer 14 (16%) respectively. The band sharing frequency was calculated for each primer, which ranged from 79 to 96. The genetic similarity within population and genetic variation were estimated as 89 and 11 percentage respectively. In conclusion, the existence of high level of polymorphism after ten generation of selection may indicate the accuracy of genetic evaluation program, suitable selection strategies and also large enough effective population size in this breeding flock.