بررسي پروفايل طولي تنوع ژنتيكي جنس Epeorus رودخانه گاماسياب در فصول مختلف سال

Investigation on genetic diversity of Epeorus along Gamasiab River in different seasons

اين مطالعه با هدف بررسي تنوع ژنتيكي جنس Epeorus در طول رودخانه گاماسياب انجام شد. نمونه‌برداري از Epeorusها از چهار ايستگاه به ترتيب از سرچشمه رودخانه به سمت پايين با فاصله حدود 500 متر از يكديگر، در چهار فصل سال و با سه تكرار از قسمت‌هاي جانبي و وسط رودخانه توسط نمونه‌بردار سوربر صورت گرفت. پس از جداسازي و فيكس Epeorusها، مراحل استخراج DNA انجام و كيفيت آن­ها روي ژل الكتروفورز بررسي شد. سپس تكثير ژن مورد مطالعه (سيتوكروم اكسيداز-1) با استفاده از آغازگرهاي مشخص انجام شد و محصولات PCR توالي‌يابي شد. هم‌رديف‌سازي، بررسي و مقايسه توالي‌ها با نرم‌افزار MEGA 6 صورت گرفت. بررسي‌هاي مولكولي حاكي از آن بود كه كاهش تنوع ژنتيكي در ايستگاه شماره 2 كه در معرض آلودگي پساب كارگاه تكثير و پرورش ماهي قرار داشت به ويژه در فصولي كه رودخانه با كاهش دبي آب مواجه شده بود، مشهود است.

This study was conducted to determine the profile of Epeorus genetic diversity along the Gamasiab River. The sampling was done from four stations ranged source of the river downward, about 500 meters from each other, in four seasons with three replications from the middle and riverside of the river by the Surber sampler. After isolation and fixation of the Epeorus, the DNA extraction steps were performed and the quality of DNA was investigated on the electrophoresis gel. After gene amplification using specific cytochrome oxidase subunit I (COI) primers, PCR products were sequenced. Sequencing was performed with MEGA 6 software. Molecular investigations indicated that the reduction of genetic diversity at station 2 exposed to wastewater and trout farm effluents, especially in the seasons which are associated with decreasing water charge.