مراودۀ ژني در نواحي هيبريداسيون بين زيرگونه‌هاي موش خانگي (M. m. castaneus و M. m. domesticus) با استفاده از ژنوم ناحيۀ D-loop ميتوكندري

Gene Exchange in Hybridization Regions between House Mouse Complex Subspecies (M. m. castaneus and M. m. domesticus) using Mitochondrial Genome of D-loop Region (mtDNA)

مطالعه دربارۀ مناطق هيبريد جانوري از‌نظر ژنومي طي دهۀ اخير درحال انجام‌ است. بحث دربارۀ نفوذ (Introgression) ژنوم در فرايند تكامل بين دانشمندان چالش‌برانگيز است؛ هرچند كاهش‌يافتن ورود ژن در مناطق مختلف نشان‌دهندۀ درگيربودن ژن‌هاي گونه‌زايي است. در بررسي حاضر، عوامل جغرافيايي دخالت‌كننده در نفوذ ژن با شاخص هيبريداسيون (كلاين ژنومي) مقايسه شدند. در مطالعۀ حاضر، 127 توالي بررسي شدند كه 82 توالي به M. m. castaneus و 45 توالي به M. m. domesticus مربوط بودند. 140لوكوس ازاينتوالي‌هااستخراج و در تجزيه‌وتحليل‌ها وارد شدند. بررسي نتايج با نرم‌افزارهاي Introgression و Barrier نشان داد ژنوم زير‌گونۀ M. m. domesticus به‌تدريج درحال نفوذ به درون زيرگونۀ M. m. castaneus است و زيرگونۀ M. m. domesticus زيرگونۀ مهاجم و زيرگونۀ M. m. castaneus زير‌گونۀ پذيرنده شناخته‌ شد؛ همچنين عوامل طبيعي از‌جمله كوه‌ها، درياچه‌ها و نمكزارهايي شناسايي ‌شدند كه نقش مانع ژنتيكي را براي اين دو زيرگونه در ايران بازي مي‌كنند. نتايج كلاين ژنومي نفوذ نامتقارن ژنتيكي را نشان دادند.

Genomic aspects of animal’s hybrid zone are studding in the recent decade. Introgression of gene in the evolution process is a very challenging issue among scientists. Gene flow reduction is probably a consequence of the speciation genes involvement. In this study, the influence of different geographical factors on gene introgression in hybrid index (genomic cline) was analyzed. We investigated 127 D-Loop sequences containing 140 independent loci for analysis: 82 sequences from M. m. castaneus and 45 sequences from M. m. domesticus. Results of the Introgress and Barrier programs showed gene invasion of M. m. domesticus subspecies in genomic background of M. m. castaneus subspecies. So, M. m. domesticus subspecies acts as an invasive subspecies and M. m. castaneus as a genome receptor. Also, our results showed that environmental elements such as mounts, lakes and salt marsh play the role of the barrier between the two subspecies in the studied regions. The results of the genomic cline represent the asymmetric genomic influence