كليدواژه :
برنامۀ كامپيوتري , CLUMPP Distruct , STRUCTURE , STRUCTUREasy , ساختار , ژنتيك جمعيت
چكيده فارسي :
تحليل ساختار ژنتيكي جمعيت‌ها براساس نشانگرهاي مولكولي عموماً با استفاده از سه برنامۀ كامپيوتري STRUCTURE، CLUMPP و Distruct به‌طور متوالي انجام مي‌شود. دو برنامۀ CLUMPP و Distruct واسط گرافيكي كاربر ندارند و براي اجراي آنها لازم است پژوهشگر ويژگي‌هاي فايل‌هاي ورودي و خروجي و تنظيمات مربوط به انتخاب الگوريتم‌ها و شاخص‌ها را در خارج از برنامه‌هاي اصلي به‌طور دستي آماده كند. تاكنون نرمافزارهاي كمكي مختلفي براي تسهيل كار نوشته شده‌اند كه بيشتر به‌طور آنلاين يا وابسته به پكيج آماري R هستند. در مقالۀ حاضر با مرور اهداف و روش‌هاي تحليل ساختار جمعيت با استفاده از داده‌هاي نشانگرهاي مولكولي داميننت، برنامۀ كامپيوتري جديد STRUCTUREasy كه روند تحليل‌ها را تسريع مي‌كند و به آشنايي با زبان برنامه‌نويسي نياز ندارد، معرفي مي‌شود. اين برنامه به‌شكل متن باز و داراي واسط گرافيكي ساده و قابل‌اجرا در محيط MicrosoftOffice است. كاربرد آن در استخراج ماتريس‌هاي Q و اتصال آنها به نرمافزارهاي پايين‌دست و فراهم‌كردن سرعت و دقت بيشتر براي تحليل ساختار ژنتيك جمعيت با استفاده از نشانگرهاي چندلوكوسي است. اين برنامۀ كامپيوتري در محيط بانك اطلاعاتي Microsoft Access 2016 اجرا مي‌شود و تمام تنظيمات و عمليات استخراج داده‌ها بين نرمافزارهاي STRUCTURE، CLUMPP و Distruct را براي افزايش سرعت و دقت انجام مي‌دهد.
چكيده لاتين :
Analysis of population genetic structure using multilocus data, is generally performed by sequential run of the three computer programs, namely STRUCTURE, CLUMPP, and Distruct. The two latter programs lack Graphical User Interface (GUI), and the user must manually create inputs and settings files, using text editors out of the program environment. A number of facilitating programs have been developed, which are online, or dependent on statistical packages such as R. In this paper, after reviewing the aims and methods for analyzing the structure of populations using dominant molecular marker data, a new computer program, STRUCTUREasy is introduced. This program simplifies the analysis procedures, with no need for programing skills. STRUCTUREasy is an open source program with a simple user interface, running in Microsoft Office. Its application is for the extraction of Q-matrices of STRUCTURE and connecting the input files to downstream software, for providing ease of use, and more accuracy and pace, in population structure analysis using multilocus markers. This program runs in Microsoft Access 2016, and performs well in extracting data and settings between STRUCTURE, CLUMPP and Distruct software, for accuracy and pace.
