تنوع ژنوتيپي سويه هاي مقاوم مايكوباكتريوم توبركلوزيس جداشده از بيماران مسلول مركز آذربايجان شرقي با روش MIRU-VNTR

Genotypic diversity of resistant Mycobacterium tuberculosis strains isolated from tuberculosis patients in East Azerbaijan center by MIRU-VNTR

سابقه و هدف: بيماري سل به دليل گسترش مقاومت، به يكي از جدي ترين بيماري ها تبديل شده است. مطالعات اپيدميولوژي مولكولي سل با تعيين تنوع ژنتيكي سويه هاي مورد گردش در جوامع به منظور برنامه هاي كنترلي اين بيماري اهميت دارد. اين مطالعه با هدف بررسي اپيدميولوژي مولكولي سل مقاوم به دارو در بين بيماران دو كشور ايران و جمهوري آذربايجان انجام گرفت. مواد و روش ها: جدايه هاي حاصل از بيماران مسلول شهر تبريز و كشور جمهوري آذربايجان به مدت يك سال مورد بررسي قرار گرفتند. تمامي جدايه ها با روش هاي بيوشيميايي به عنوان مجموعه مايكوباكتريوم توبركلوزيس تشخيص داده شدند و با روش نسبي براي داروهاي ايزونيازيد، ريفامپسين، استرپتومايسين و اتامبوتول تعيين حساسيت شدند. پس از استخراج DNA، لوكوس هاي MIRU تكثير شدند و تعداد تكرارهايشان در مقايسه با سويه استاندارد H37Rv تعيين گرديد. تعيين ژنوتيپ بر اساس الگوي تعداد تكرارهاي مجموعه لوكوس هاي 15 گانه مورد مطالعه، با استفاده از سايت مرجع MIRU-VNTRplus انجام گرفت. يافته ها: از مجموع 119 جدايه مورد بررسي، مقاومت حداقل به يك دارو و مقاومت چند دارويي (MDR) به ترتيب در 27.73 و 6.72 درصد موارد شناسايي شد. همچنين خانواده هاي ژنوتيپي شناخته شده شامل Uganda I ،Uganda II ، LAM ، TUR ، Delhi/CAS ، Bovis ، Beijing ، NEW-1 و Cameron بودند. نتيجه گيري: نتايج نشان داد كه ميزان و الگوي مقاومت دارويي و نيز خانواده هاي ژنوتيپي در بين مردم تبريز و كشور آذربايجان تفاوت دارند، اما اين شاخص ها براي جمهوري آذربايجان نسبت به تبريز متنوع تربودند.

Background & Objectives: Tuberculosis has become one of the most serious diseases due to the increased prevalence of resistance. To control the disease, tuberculosis molecular epidemiological studies are important in determining the genetic diversity of strains circulating in communities. The aim of this study was to investigate the molecular epidemiology of drug-resistant tuberculosis among patients in Iran and Azerbaijan. Materials & Methods: The isolates from tuberculosis patients of the Azerbaijan Republic and Tabriz were studied from March 2014 to March 2015. All isolates were identified as Mycobacterium tuberculosis complex by biochemical methods and drug susceptibility testing against isoniazid, rifampicin, streptomycin, and ethambutol was performed by proportional method. Following DNA extraction, each MIRU locus was amplified individually to determine their repeat numbers as compared to H37Rv standard strain. Finally, genotyping was performed according to the repeat numbers of subsets of 15 studied loci using the MIRU-VNTRplus reference website. Results: Totally of 119 obtained isolates, resistance to at least one drug of the first line of anti-TB drugs and multidrug resistance were observed as 27.73 and 6.72 percent, respectively. Cameron, UgandaӀ, UgandaӀӀ, LAM, TUR, Dehli/CAS, Bovis, Beijing, NEW-1 and H37Rv were among genotypic families which were determined. Conclusion: According to the results of this study, the rate and pattern of drug resistance and genotypic families are different among the people of Tabriz and Azerbaijan, but the indicators were more diverse in Azerbaijan as compared to Tabriz.