شناسايي جهش هاي ژن NS5B ژنوتيپ 1a ويروس هپاتيت C در استان گيلان

Study of NS5B gene mutations in hepatitis C virus genotype 1a in Guilan Province

سابقه و هدف: ويروس هپاتيت C عامل اصلي هپاتيت مزمن كبدي است كه ساليانه باعث مرگ هزاران نفر در دنيا مي گردد. پروتئين NS5B، RNA پلي مراز وابسته به RNA است كه توسط ژن NS5B كد مي شود و در همانندسازي ويروس نقش دارد. از جمله داروهاي موثر در درمان اين عفونت هاي ناشي از اين ويروس مهاركننده هاي پروتئين NS5B مي باشند. ظهور سويه هاي مقاوم به اين داروها يك مانع بزرگ در موفقيت درمان مي باشد. هدف از اين مطالعه بررسي جهش هاي احتمالي در ناحيه NS5B ژنوتيپ 1a ويروس هپاتيت C در استان گيلان است. مواد و روش ها: RNA ژنومي ويروس از پلاسماي 225 بيمار آنتيHCV مثبت استخراج و شناسايي مولكولي و تعيين سروتيپ آن به روشRT-PCR و تعيين توالي محصول انجام شد. پس از آن ژن NS5B در 10 سويه داراي ژنوتيپ 1a تكثير و به منظور شناسايي جهش ها توالي يابي گرديد. يافته ها: به ترتيب ژنوتيپ هاي (3a (53.3 درصد و (1a (36.9 درصد) فراوان ترين ژنوتيپ هاي شناسايي شده در گيلان بودند. بر اساس نتايج توالي يابي، از ميان 10 سويه داراي ژنوتيپ 1a مورد بررسي در 5 سويه ، 7 نوع جهش بدمعني در كدون هاي Q309، A327، S254، K304، N307، R250 و A334 شناسايي شد. نتيجه گيري: ژنوتيپ 1a از ژنوتيپ هاي شايع ويروس هپاتيت C در گيلان مي باشد. شناسايي جهش ها يا پلي مورفيسم مرتبط با مقاومت در ويروس هپاتيت C مي تواند در بهينه سازي درمان و تعيين كارايي داروها در درمان هپاتيت C مفيد باشد.

Background & Objectives: Hepatitis C virus is the main cause of chronic hepatitis, resulting in a thousand deaths every year. NS5B protein is an RNA-dependent RNA polymerase that is encoded by the NS5B gene and involved in virus replication. One of the most effective drugs in the treatment of infections caused by this virus are NS5B protein inhibitors. The emergence of the strains resistant to these drugs is a major obstacle to the success of treatment. The aim of this study was to investigate possible mutations in the NS5B region of hepatitis C virus genotype 1a in Guilan province. Materials & Methods: HCV genomic RNA was extracted from the plasma samples of 225 anti-HCV positive patients and its molecular identification and genotyping was carried out by RT-PCR and product Sequencing. Then, the NS5B gene was amplified in 10 strains with genotype 1a and subsequently sequenced to determine mutations in this region. Results: Genotypes 3a (53.3%) and 1a (36.9%) were the most abundant genotypes identified in Guilan. According to sequencing results, out of 10 investigated genotype 1a strains, 5 strains showed 7 types of missense mutations in codons Q309, A327, S254, K304, N307, R250, and A334. Conclusions: Genotype 1a is one of the common genotypes of hepatitis C virus in Guilan. Identifying mutations or polymorphisms associated with resistance in hepatitis C virus can be useful in optimizing the treatment and determining the efficacy of drugs in treating hepatitis C virus.