بررسي بيوانفورماتيكي ميانكنش بين ميكرو RNAها با ژن‌هاي دخيل در عود مجدد سرطان پستان درمان شده با تاموكسيفن

زمينه و هدف: تاموكسيفن رايج ترين درمان مورد استفاده براي بيماران مبتلا سرطان پستان نوع ER+ محسوب مي شود كه مانع از بيان ژن هاي موثر در رشد و تكثير سلول هاي سرطاني توسط استروژن مي گردد. مقاومت به تاموكسيفن يك مشكل باليني مهم در سرطان پستان به شمار مي رود، در بررسي هاي جديد نقش ميكرو RNA ها در مقاومت به تاموكسيفن، از طريق تاثير بر تنظيم ژن هاي كنترل كننده ي چرخه سلولي، مطرح شده است. در اين مقاله ميانكنش ميكروRNA ها با ژن هاي دخيل در مقاومت به تاموكسيفن مورد بررسي قرار گرفته است. روش بررسي: با برسي داده هاي بيان ژن در نمونه هاي بيماران حساس و مقاوم به تاموكسيفن كه از پايگاه داده GEO دريافت شده بود و جستجو در پايگاه مقالات، ژن ها و ميكرو RNA هايي كه داري تغييرات بياني معني دار بودند تعيين گرديدند. سپس با بررسي همبستگي بين بيان ژن ها و ميكروRNAها و همچنين بررسي بيوانفورماتيكي به وسيله نرم افزار mirwalk، شبكه ميانكنشي بين ژن ها و ميكرو RNA ها ترسيم گرديد. يافته ها: بررسي ها نشان دادند 21 ژن و 62 ميكروRNA در نمونه هاي مقاوم به تاموكسيفن تغيير بيان يافته اند كه miR342-3P/5P با هدف قرار دادن ژن هاي HOXB13، PRM2 و KLK3 و ميكروRNA هاي MiR-520h و miR-582-5p با هدف قرار دادن 5 ژن كاهش بيان يافته، مي توانند بيشترين نقش را در عود مجدد سرطان پستان ايفا نمايند. نتيجه گيري: شبكه ي تنظيمي ترسيم شده بين مجموعه اي از ژن ها و ميكرو RNA هايي كه به صورت بالقوه در عود مجدد سرطان پستان درمان شده با تاموكسيفن، داراي نقش مي باشند، مي تواند روشن كننده نقش ميكرو RNA ها در بازگشت مجدد سرطان پستان باشد. -