جداسازي و شناسايي مولكولي جدايه‌هاي محرك رشد گياهي جنس‌هاي Bacillus و Pseudomonas

Isolation and molecular identification of isolates of plant growth promoting Pseudomonas and Bacillus

استفاده از تأثير سينرژيستيك باكتري‌هاي تثبيت كننده نيتروژن و باكتري‌هاي محلول كننده فسفات از جديدترين استراتژي‌هاي توليد كود زيستي است. نمونه‌هاي خاك رايزوسفري از گلخانه‌هاي تجاري خيار، گوجه‌فرنگي و فلفل دلمه‌اي واقع در استان‌هاي كرمان، يزد و اصفهان جمع‌آوري و با استفاده از محيط كشت‌هاي انتخابي براي Pseudomonas و Bacillus غربال شد. تعداد 108 جدايه Pseudomonas و 92 جدايه Bacillus با صفات PGP جداسازي و شناسايي شد. پنجاه و سه درصد از جدايه‌هاي Pseudomonas و 25% از جدايه‌هاي Bacillus قادر به رشد بر روي محيط بدون نيتروژن بودند. نود و شش درصد از جدايه‌هاي Pseudomonas قادر به انحلال فسفات معدني بودند و 70% از آن‌ها اكسين توليد كردند در حاليكه هيچ يك از جدايه‌هاي Bacillus واجد اين صفات نبودند. سي درصد از جدايه‌هاي هر دو جنس سيدروفور توليد كردند هر چند نسبت قطر هاله به كلني جدايه‌هاي Pseudomonas بزرگ‌تر بود. تنها 5% از جدايه‌هاي Bacillus و 31% از جدايه‌هاي Pseudomonas از رشد بيمارگر Phytophthora melonis ممانعت كردند. بر اساس اين نتايج، اگرچه جدايه‌هاي PGP از هر دو جنس در خاك رايزوسفري گلخانه‌هاي تجاري يافت شد اما اين باكتري‌ها در صفات محرك رشدي متفاوت بودند. يك جدايه Pseudomonas بنام P3-57 و يك جدايه Bacillus به نام C1BY-1 با توان ممانعت از رشد بيمارگر به ميزان 50% كه از نظر صفات محرك رشدي تفاوت داشتند براي مطالعه در شرايط گلخانه انتخاب شدند. بررسي تبارشناسي توالي ژن 16S rRNA نشان داد كه سويه P3-57 و C1BY-1 به ترتيب شباهت زيادي با P. putida و B. subtilis دارند.

The use of the synergistic effect of nitrogen-fixing bacteria and phosphate solubilizing bacteria is one of the newest biofertilizer production strategies. Rhizosphere soil samples were collected from tomato, cucumber and bell pepper commercial greenhouses and screened for Pseudomonas and Bacillus using selective media. One hundred and eight Pseudomonas and 92 Bacillus isolates with PGP activities were isolated and characterized. Fifty-three percent of Pseudomonas isolates and 25% of Bacillus were able to grow on N free medium. Ninety-six percent of Pseudomonas isolates were able to solubilize organic phosphate and 70% of them produce IAA, while none of the Bacillus had these two abilities. About 30% of Pseudomonas and Bacillus isolates produces siderophore, although the ratio of orange halo diameter/colony diameter was greater for Pseudomonas. Only five Bacillus and 31 Pseudomonas isolates inhibited the growth of Phytophthora melonis. Based on these results, although PGP isolates of both genera were found in the rhizosphere soil of commercial greenhouses, these bacteria differed in PGP traits. A Pseudomonas isolate, P3-57 and a Bacillus isolate, C1BY-1 with 50% antagonistic activity against P. melonis which differed in PGP traits selected for future study in greenhouse conditions. Phylogenetic analyses of 16S rRNA gene sequence revealed that strains P3-57 and C1BY-1 are closely related to P. putida and B. subtilis respectively.