بررسي تنوع ژنتيكي جمعيت هاي مختلف تربچه با استفاده از نشانگرهاي رتروترانسپوزوني ريزماهواره

Genetic diversity of some population of Radish (Raphanus sativus) using REMAP marker

به منظور بررسي تنوع ژنتيكي گياه دارويي تربچه از 36 آغازگر REMAP استفاده شد. آغازگرهاي UBC825-Ltr2، UBC815-Ltr1 و UBC815-Ltr20 با 6 آلل كم ترين و آغازگر UBC848-Ltr3 با 17 آلل بيش ترين و ميانگين تعداد آلل در كل جايگاه ها برابر 10/04 بود. بيش ترين ميزان شاخص چندشكلي (0/41) مربوط به آغازگر UBC848-Ltr2 و كم ترين ميزان شاخص (0/24) مربوط به آغازگر UBC818-Ltr15 بود. بيش ترين ميزان شاخص ماركري (34/69) مربوط به آغازگر UBC848-Ltr2 و كم ترين ميزان شاخص ماركري (20/63) مربوط به آغازگر UBC857-Ltr1 بود. بيش ترين ميزان تعداد الل موثره، شاخص تنوع شانن و شاخص تنوع ني به ترتيب 1/73، 0/42 و 0/61 متعلق به آغازگر UBC825-Ltr2 و كم ترين ميزان تعداد آلل موثر، شاخص تنوع شاندن و شاخص تنوع ژني به ترتيب 1/26، 0/18 و 0/31 متعلق به آغازگر UBC815-Ltr15 بود و در بين جمعيت هاي تربچه بيش ترين درصد مكان چندشكل، تعداد الل موثر، شاخص تنوع ژني و شاخص تنوع شاندن به ترتيب 89 درصد، 42/18، 1/3، 0/170 و 0/248 متعلق به جمعيت French breakfast بود. تغييرات درون و بين جمعيت ها با استفاده از تجزيه واريانس مولكولي نشان داد كه 66 درصد كل تغييرات ژنتيكي درون جمعيت ها وجود دارد.

In this research were used 36 REMAP marker to evaluate genetic diversity among radish population. 6 alleles were amplified by UBC825-Ltr2, UBC815-Ltr1 and UBC815-Ltr20 primers and 17 alleles were amplified by UBC848-Ltr3 primer, minimum and maximum allele numbers respectively with average of 10.04 alleles. The highest diversity index (0.41) among remap primers was belong to UBC848-Ltr2 primer and the lowest (0.24) belong to UBC848-Ltr2 Primer, The highest Marker Index (34.69) among remap primers was belong to UBC848-Ltr2 and the lowest (20.36) belong to UBC857-Ltr1, the most Ne allele, Shanon diversity and Nei diversity (1.73, 0.42 and 0.61 respectively) among remap primers was belong to UBC825-Lt2 primer and the lowest Ne allele, Shanon diversity and Nei diversity (1.26, 0.18 and 0.31 respectively) was belong to UBC815-Ltr15 primer and also the most diversity loci, Ne allele, Nei diversity and Shanon diversity (89%, 42.18, 1.3, 0.17 and 0.248 respectively) among radish population was belong to French breakfast population. Partitioning variations within and between populations, using an analysis of molecular variance (AMOVA), showed that 66% of the total genetic variation existed within growing regions.