ارزيابي تنوع ژنتيكي در برخي ارقام ايراني و خارجي و ژنوتيپ هاي اميد بخش زيتون با استفاده از نشانگرهاي ISSR

Evaluation of genetic variation in some Iranian and foreign cultivars and promising genotypes of Olive using ISSR markers

زيتون به عنوان يكي از مهم ترين گياهان باغي شناخته مي شود كه داراي بيش از 1200 رقم كاملا متمايز و تعداد فراواني رقم وحشي در جهان است. در اين مطالعه تنوع ژنتيكي موجود در يك مجموعه از ارقام زيتون ايراني و خارجي با استفاده از نشانگرهاي ISSR ارزيابي شد. در مجموع 16 آغازگر، 190 قطعه تكثير يافت كه 172 قطعه از آن ها (52/90 درصد) چند شكل بود. ميانگين شاخص هاي قدرت تمايز (Rp) و محتواي اطلاعات چند شكل (PIC) به ترتيب برابر با 10/22 و 0/45 بود كه بيانگر قابليت آغازگرهاي استفاده شده در ارزيابي تنوع ژنتيكي بود. نتايج تجزيه واريانس مولكولي (AMOVA) نشان داد كه 7 درصد از تغييرات كل، مربوط به تنوع بين گروهي و 93 درصد از تغييرات مربوط به تنوع درون گروهي ارقام و ژنوتيپ هاي زيتون بود. ميانگين درصد مكان هاي چند شكل (PPL)، تعداد آلل هاي مشاهده شده (Na) و موثر (Ne)، اطلاعات شانون (I) و تنوع ژنتيكي (H) به ترتيب برابر با 82/11 درصد، 1/73، 1/43، 0/39 و 0/26 بود و ارقام ايراني نسبت به خارجي از نظر كليه پارامترهاي تنوع ژنتيكي داراي مقادير بالاتري بودند. روابط ژنتيكي بين ارقام مورد بررسي با استفاده از تجزيه خوشه ايبررسي شد و نتايج به دست آمده نشان داد كه كليه ارقام درون سه گروه اصلي قرار گرفتند. نتايج تجزيه به مختصات اصلي (PCoA) نيز تاييد كننده نتايج حاصل از تجزيه خوشه ايبود. به طور كلي، نتايج حاصل از اين مطالعه نشان داد نشانگرهاي ISSR استفاده شده به طور مطلوبي قادر به منعكس نمودن ميزان تنوع ژنتيكي و روابط بين ارقام زيتون هستند. از اينرو، استفاده از اين آغازگرها در ساير مطالعات ژنتيكي مانند نقشه يابي QTL و تجزيه ارتباطي قابل توصيه مي باشد.

Olive is considered one of the most significant crops, with more than 1200 distinctive cultivars and an abundant number of wild forms. In this study, the genetic diversity in a set of Iranian and foreign olive cultivar was evaluated using ISSR primers. Using 16 ISSR primers, a total of 190 bands amplified, which out of 172 were polymorphic. The average of resolving power (Rp) and polymorphic information content (PIC ) was 10.22 and 0.45, respectively, hence this indicating the high efficiency of these primers to further genetic diversity assay. The results of analysis of molecular variance (AMOVA) showed 7% of the total genetic diversity refer to among groups, while 93% of the total variation was found within groups. The average percentage polymorphic loci (PPL), number of observed (Na) and effective (Ne) alleles, Shannon’s information index (I), and gene diversity (H) are 82.11%, 1.73, 1.43, 0.39 and 0.26, respectively, and Iranian cultivars showed higher amounts of all parameters than foreign cultivars. Genetic relationships inferred from a neighbor-joining dendrogram clustered cultivars into main three groups. This grouping pattern was matched with the groups obtained by principal coordinate analysis (PCoA). Taken together, the results obtained from this study indicate the ISSR primers used in this work will be useful for genetic diversity and phylogenetic studies in the olive cultivars. Hence, the use of these primers in other genetic studies like QTL and association mapping are recommended.