شناسايي و تعيين خصوصيات ميكرو RNA‌هاي محافظت شده Coriandrum sativum L.با استفاده از داده‌هاي توالي‌يابي نسل جديد

ميكرو RNA‌ها (miRNAs) گروهي از مولكول‌هاي RNA كوچك و غير كدكننده‌ با طولي حدود 24-18 نوكلئوتيد هستند كه بيان ژن‌هاي هدف خود را در سطوح مختلف رونويسي و پس از رونويسي در گياهان كنترل مي‌كنند. ميكرو RNA‌ها در فرآيندهاي مختلفي مانند رشد و نمو، فرآيندهاي زيستي، تكثير سلولي و پاسخ به تنش‌ها در گياهان نقش مهمي بازي مي‌كنند. گشنيز زراعي با نام علمي (Coriandrum sativum L.) گياهي از خانواده چتريان (Apiaceae) است كه داراي كاربردهاي غذايي و دارويي مختلفي است. ژنوم اين گياه تاكنون توالي‌يابي نشده است و هيچ‌گونه گزارشي از شناسايي ميكرو RNA‌ها براي آن ثبت نشده است. مطالعه حاضر به‌منظور شناسايي ميكرو RNA‌هاي محافظت شده بالقوه و ژن‌هاي هدف آن‌ها در ترنسكريپتوم گياه گشنيز صورت گرفت. ابتدا ترنسكريپتوم بافت‌هاي بذر و برگ اين گياه سرهم‌بندي شد و رونوشت‌هاي غير كد‌كننده به پروتئين شناسايي و به‌عنوان توالي‌هاي كانديد پيش‌ساز ميكرو RNA در نظر گرفته شدند. در نهايت از بين توالي‌هاي كانديد سه ميكرو RNA با نام‌هاي csa-miR162، csa-miR169 و csa-miR399 متعلق به سه خانواده محافظت شده ميكرو RNA پس از اعمال فيلترهاي سخت‌گيرانه شناسايي شد. ميكرو RNAهاي شناسايي شده داراي بيان متفاوتي در بافت‌هاي بذر و برگ بودند و نقش ژن‌هاي هدفشان در فرآيندهاي مختلف زيستي نيز مورد تأييد قرار گرفت. در مجموع با توجه به اينكه ميكرو RNAهاي شناسايي شده در مطالعه حاضر داراي نقش تنظيمي بر طيف وسيعي از شبكه‌هاي ژني و فرآيندهاي زيستي مختلف در گياه گشنيز هستند، مي‌توان از آن‌ها به‌عنوان ژن‌هاي كانديد در بهبود عملكرد كمي و كيفي و همچنين مقاومت به تنش‌هاي مختلف در اين گياه بهره برد.