پديد آورندگان :
كريمي، غلامرضا سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي كرج , رنجبر، محمد مهدي سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي كرج , احمدي، نائبعلي دانشگاه علوم پزشكي شهيد بهشتي , يزدان ستاد، سجاد سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي كرج
كليدواژه :
آنولاتوس , ميكروپولوس , كنه ريپي‌سفالوس , كُبرا , واكسن
چكيده فارسي :
مقدمه: گونه‌هاي كنه ريپي‌سفالوس سبب ضررهاي اقتصادي قابل‌ملاحظه‌اي در ايجاد بيماري در حيوانات و همچنين انسان مي‌شوند. Bm86 كه يك پروتئين معدي كانديد واكسن مي‌باشد توالي آن در بين جدايه‌هاي گونه‌هاي ريپي‌سفالوس از نظر جغرافيائي جدا از هم، متغير و دليل اصلي كاهش اثربخشي و شكست واكسن‌هاي نوتركيب است.
روش: در اين مطالعه بيوانفورماتيكي توالي‌هاي انگل هاي ريپي‌سفالوس ميكروپولوس و آنولاتوس استخراج، هم‌رديف و اصلاح گرديدند. سپس نمودار تغيير‌پذيري و درخت فيلوژنتيك براي آن‌ها ترسيم شد. سپس گروه‌بندي و علامت‌گذاري تاكسون‌ها جهت طراحي واكسن تكاملي، آنتي‌ژن كُبرا، مركز درخت و اجدادي صورت گرفت. همچنين بر روي توالي‌هاي واكسني كُبرا آناليزهاي مدل‌سازي و آزمون بر هم‌نهي انجام گرفت.
نتايج: در دو گونه ميكروپولوس و آنولاتوس، بيشترين تغييري‌پذيري به ترتيب در حدود آمينواسيد‌هاي 177 تا 181، 270 تا 276 و 351 تا 352 مشاهده گرديد. 6 توالي به عنوان توالي مناسب جهت طراحي واكسن تكاملي و 12 توالي نيز جهت هم‌رديفي مجدد و بدست آوردن توالي مورد توافق جهت طراحي آنتي‌ژن كُبرا استفاده گرديد. از سوي ديگر توالي مربوط به ريپي‌سفالوس آنولاتوس در شاخه‌هاي خواهري بوده و بيشتر به يكديگر شبيه بودند تا به توالي‌هاي BM86 ريپي‌سفالوس ميكروپولوس، به جزء توالي ADQ19687. توالي‌هاي انتخابي جهت طراحي واكسن بر مبناي مركز درخت و اجدادي نيز به ترتيب از توالي‌هاي AJE29931، AJE29932 و ATW75472 و توالي‌هاي ATW5476، ADM86722، ACZ55133 معرفي شدند.
نتيجه‌گيري: واكسن ضد كنه‌اي مبتني بر روش كُبرا براي Bm86 مي‌توانند وسيع‌الطيف‌تر، مقرون به صرفه‌تر و جايگزين بهتري در مقايسه با واكسن‌هاي نوتركيب فعلي باشند.
چكيده لاتين :
Introduction: The cattle tick Rhipicephalus spp. causes significant economic losses due to diseases in animals and human. Bm86 is a midgut protein and vaccine candidate, which its sequences among the isolates of Ripsephalus spp are geographically separated, variable, and are the main reason for reducing effectiveness, and subsequently, the failure of the recombinant vaccines.
Method: In this bioinformatics study, the sequences of R. microplus and R. annulatus were retrieved, aligned, and edited. Then, the variation plot and phylogenetic tree were constructed. Afterwards, grouping and taxa marking for designing evolutionary vaccine, COBRA antigen, center of tree and ancestral were done. Also, over COBRA vaccine sequences, modeling analysis and superimpose test were done.
Results: In both R. microplus and R. annulatus, the most variable region were residues 177-181, 270-276, and 351-352, respectively. 6 sequences were selected as appropriate sequences for design of evolutionary vaccine, and 12 for the realignment of and achieving sequences for design of COBRA antigen. On the other hand, R. annulatus sequences were in sister branches and more similar to each other compared to Bm86 protein sequences in R. microplus except ADQ19687. The sequences selected for vaccine design based on the center of tree and ancestral, were AJE29931, AJE29932, and ATW75472, and ATW5476, ADM86722, ACZ55133 sequences, respectively.
Conclusion: Anti-tick COBRA-based vaccines of Bm86 could be more cost-effective and better alternative with broader spectrum, compared to the commonly used recombinant vaccines.
