استفاده از آناليز به روش (Single Nucleotide Polymorphism (SNP به عنوان يك راهبرد بررسي ژنتيكي در مطالعات پاراتوبركولوزيس در ايران

ژنوتايپينگ مايكوباكتريوم ايويوم زيرگونه پاراتوبركولوزيس (MAP) حتي با وجود دسترسي به تكنيك‌هاي مولكولي متعارفي نظير PFGE, RFLP, SSR and MIRUVNTR همچنان به عنوان يك چالش محسوب مي‌گردد بدان سبب كه اين باكتري از نظر ژنتيكي بسيار يكنواخت و همگن مي‌باشد. به نظر مي‌رسد كه در شرايط امروزي پاراتوبركولوزيس در سراسر ايران انتشار يافته است چرا كه گزارشات مربوط به وقوع بيماري در گله‌هاي گاو گوسفند و بز بصورت فزاينده در هر سال انتشار مي‌يابند. ميزان اطلاعات موجود از ساختار جمعيت اين باكتري در ايران محدود مي‌باشد. يافته‌هاي موجود حاكي از فعاليت جدايه‌هاي متعلق به تيپ معروف به گاوي مي‌باشند و اين در حالي است كه تاكنون نشانه‌اي از وجود تيپ گوسفندي در ايران يافت نشده است. در اين تحقيق يك سيستم ژنوتايپينگ (Single Nucleotide Polymorphism (SNP متشكل از 13 لوكوس و با اتكا به PCR بر روي يك جدايه بومي MAP اجرا گرديد. آزمون به گونه‌اي انجام گرديد كه از يك پروتكل واحد PCR براي همه لوكوس‌ها استفاده شد. محصولات تكثير DNA به روش Sanger تعيين توالي شدند. نوكلئوتيدهاي هدف تعيين و شناسايي گرديدند. اين نوكلئوتيدها بطور كامل با نوكلئوتيدهاي هم ارز در ژنوم سويه آزمايشگاهي MAP K10 مطابقت داشتند و هويت جدايه ايراني را به عنوان جدايه تيپ گاوي نشان دادند. ما معتقديم اگر روش SNP معرفي شده توسط Leao در مقياس گسترده در ايران بكار گرفته شود امكان دستيابي به دانش جامع‌تر از اتفاقات و جريانات تكاملي كه وقوع آنها وضعيت اپيدميولوژيك امروز پاراتوبركولوزيس در ايران را شكل داده‌اند، فراهم گرديد.