آناليز فيلوژنتيك جدايه‌هاي كاپري پاكس ايران طي سال‌هاي 1392-1395

جنس كاپري پاكس ويروس ازخانواده پاكس ويريده شامل سه ويروس آبله گوسفند (SPV)، آبله بز (GPV) و لامپي اسكين (LSDV) مي‌باشد كه خسارات اقتصادي مهمي به دامداري در مناطق اندميك وارد كرده‌اند. از انجايي كه كاپري پاكس ويروس‌ها از لحاظ مورفولوژي و آنتي ژنيكي مشابه هستند، تفريق اين ويروس‌ها بر استفاده از روش‌هاي مولكولي متكي است. هدف از اين مطالعه تشخيص مولكولي كاپري پاكس ويروس‌هاي ايران براساس آناليز سكانس ژن همولوگ گيرنده كموكاين مي‌باشد. به اين منظور، 16 ايزوله كاپري پاكس شامل 10 ايزوله SPV، 4 ايزوله GPV و 2 ايزوله LSDV از نقاط مختلف ايران كه در سال‌هاي 1395-1392 جداسازي شده‌اند مورد استفاده قرار گرفت. ژن CKR جدايه‌ها با روش PCR تكثير شد و در وكتور pTZ57R/T كلون گرديد. آن‌ها در مقايسه با نمونه‌هاي CaPV موجود در بانك داده‌ها توالي‌يابي شده و آناليز گرديدند. آناليز توالي و فيلوژنتيك نشان مي‌دهد كه، SPVهاي ايران با بيش از 99 درصد تشابه با ديگر SPV هاي موجود در بانك ژن در يك دسته قرار مي گيرند به استثناء SPV عمان. ايزوله‌هاي GPV ايران با 99-98 درصد تشابه با ديگر ايزوله‌هاي موجود در بانك ژن در يك دسته قرار مي‌گيرند و به علاوه، با ايزوله‌هاي GPV هند و بنگلادش پروفايل ژني مشابهي را نشان مي‌دهند. ايزوله‌هاي LSDV ايران 100-99 درصد مشابه ديگر ايزوله‌هاي LSDV بانك ژن و در يك دسته قرار گرفته‌اند. به طور قطع، براساس آناليز سكانس ژن CKR ايزوله‌هاي SPV، GPV و LSD ايران كاملا متفاوت هستند.