بررسي خصوصيات فيلوژنتيكي باكتري اندوفيت سودوموناس پروتجنس با توانايي توليد تركيبات آنتاگونيستي جدا شده از گياه برگ نو

Phylogenetic Characterization oF Endophytic Bacterium Pseudomonas Protegens with Antagonistic Ability Isolated From privet

باكتري هاي اندوفيت با توانائي توليد تركيبات آنتاگونيست، قادر به كنترل بيمارگرهاي گياهي هستند. اين مطالعه به منظور بررسي توانايي توليد تركيبات آنتاگونيستي در باكتري هاي اندوفيت برگ نو انجام پذيرفته است. مواد و روش ها در اين پژوهش باكتري هاي اندوفيت از برگ و شاخه برگ نو، جداسازي گرديد، پس از استخراج DNA ژنومي، از روش PCR به منظور تكثير ژن 16S rDNA استفاده گرديد. به منظور شناسايي دقيق باكتري جداسازي شده، محصول PCR، تعيين توالي و ترادف بازي 16S rDNA BLAST گرديد. جدايه ها از نظر توليد سيدروفور، هيدروژن سيانيد و آنزيم پروتئاز مورد بررسي قرار گرفتند. يافته هاي پژوهش: تمام باكتري هاي جداسازي شده در اين پژوهش قادر به توليد آنزيم پروتئاز بودند. تنها يك سويه قادر به توليد هيدروژن سيانيد بود (BN3). نتايج آزمون سيدروفور براي يك سويه مثبت بود (BN2). نتايج تعيين توالي نشان داد كه باكتري هاي جداسازي شده متعلق به سودوموناس پروتوجنس Pseudomonas protegens است كه با سويه تيپ شباهت 100 درصدي دارد. بحث و نتيجه گيري: سويه هاي جدا شده در اين پژوهش، مي توانند در افزايش رشد گياه به كار روند. از آن جا كه كشاورزي پايدار به توانائي حفظ توليد، همراه با استمرار نگه داشت منابع و حفظ محيط زيست تاكيد دارد، لذا كاربرد باكتري هاي اندوفيت در راستاي اهداف كشاورزي پايدار است و بي شك با شناخت و كشف مكانيزم هاي دخيل مي توان به اين مهم دست يافت.

Endophytic bacteria are able to control plant pathogens by producing antagonistic compounds. This research was conducted to determine the antagonistic ability of bacterial endophytes in privet (Ligustrum vulgare L.). Materials & Methods In this study, endophytic bacteria were isolated from stem and leaf of privet (Ligustrum vulgare L.). After genomic DNA extraction, 16S rDNA gene was amplified using polymerase chain reaction (PCR) technique for precise bacterial identification. Then, the PCR product was sequenced by BLAST. Strains were examined for siderophore, hydrogen cyanide, and protease tests. Findings: All the isolated bacteria were able to produce protease. Only one strain (BN3) was able to produce hydrogen cyanide. The siderophore test was positive for one strain (BN2). Based on the 16S rDNA sequence studies, the strain bacteria belonged to Pseudomonas protegens and indicated 100% similarity to type strain. Discussion & Conclusions: The endophytic bacteria isolated in this study can be used to promote plant growth. Knowledge about endophytic bacteria-plant interaction can provide an effective strategy to develop sustainable agriculture in order to ensure yield improvement without affecting environment.