تنوع ژنتيكي درون و بين نژادهاي ايراني، فرانسوي و دانماركي ماهي قزل‌آلاي رنگين‌كمان (Oncorhynchus mykiss) با استفاده از آناليز PCR-RFLP قطعات DNA ميتوكندري

هدف از اين پژوهش، بررسي ميزان تنوع ژنتيكي بين و درون نژادهاي قزل آلاي رنگين كمان ايراني، فرانسوي و دانماركي بود. DNA ميتوكندريايي 135 نمونه (45 نمونه از هر نژاد)، به روش فنل كلروفوم استخراج شده و با استفاده از تكنيك واكنش زنجيره اي پليمراز چند شكلي طول قطعات حاصل از هضم (PCR-RFLP) مورد مطالعه قرار گرفت. قطعات شامل 986 جفت باز از D-loop و 974 جفت باز از سيتوكروم b تكثير و با آنزيم هاي هضم مختلف مطالعه شدند. هيچ كدام از نمونه ها براي آنزيم هاي هضم در D-loop تنوع ژنتيكي را نشان ندادند. با استفاده از آنزيم هاي هضم، 4 هاپلوتيپ مختلف روي ژل آگارز براي سيتوكروم b شناسايي شد كه در ميان آن ها دو هاپلوتيپ مخصوص نژادي براي نژاد دانماركي مشاهده شد. بيشترين فراواني هاپلوتيپ ها براي هاپلوتيپ AABBAB با 61 مشاهده بود. دندروگرام UPGMA بر اساس سيتوكروم b نشان داد كه نژاد ايراني با فرانسوي در يك كلاستر و از نژاد دانماركي جدا شد. فاصله ژنتيكي بين نژاد ايراني و فرانسوي 0/0008 و بين نژاد هاي ايراني و دانماركي و همچنين فرانسوي و دانماركي 0/198 بود.