بررسي تنوع ژنتيكي پروتئوس ميرابيليس جدا شده از نمونه هاي ادراري توسط روش ‌Box PCR

Genetic Diversity of Proteus Mirabilis Isolated from Urine Specimens by Box PCR

مقدمه: پروتئوس ميرابيليس يكي از عوامل شايع در عفونت هاي مجرا ادراري(UTI) مي باشد. روش هاي متعدد مولكولي جهت ژنوتايپينگ باكتري ها به كار مي رود. روش واكنش زنجيره اي پليمراز مبتني بر توالي هاي تكرار شونده با استفاده از مجموعه پرايمرهاي BOXA1R جهت افتراق و تفكيك باكتري هاي استفاده شده است. هدف از مطالعه حاضر ارزيابي تنوع ژنتيكي ايزوله­ هاي پروتئوس ميرابيليس جدا شده از نمونه ادراري مي­ باشد. مواد و روش ها: در اين مطالعه توصيفي-مقطعي، 60 ايزوله پروتئوس ميرابيليس از نمونه ادرار با استفاده از تست هاي بيوشيميايي شناسايي شد. DNA نمونه ها استخراج و آزمايش BOX-PCR صورت گرفت. يافته هاي پژوهش: نمودار درختي يا دندوگرام آزمون BOX-PCR ترسيم شد و نتايج نشان داده شد كه تمامي سويه­ ها در سطح تشابه 57 درصد به 7 كلاستر مجزا تفكيك شدند. در گروه اول سه ايزوله، 9 ايزوه در گروه دوم، در گروه سوم 18 ايزوله، 2 ايزوله در گروه چهارم، 11 ايزوله در گروه پنجم، يك ايزوله در گروه ششم و 16 ايزوله در گروه هفتم قرار گرفتند. آناليز دندوگرام مشخص نمود كه سويه­ هاي متعلق به يك سرووار از يكديگر قابل تفريق هستند. بحث و نتيجه گيري: اين روش نشان داد كه انگشت نگاري مولكولي با پرايمر BOXA1Rجهت تايپينگ جدايه ­هاي باكتري ها از منشاء متفاوت و مختلف مفيد مي ­باشد. هم چنين داراي قدرت تفريق و تمايز بسيار مناسب، استفاده مطلوب در مطالعات اپيدميولوژي و رديابي منبع عفونت و تاكسونومي هستند.

Introduction: Proteus mirabilis is one of the common causes of UTI.Multiple molecular methods are used to genotype bacteria.The polymerase chain reaction method is based on repeated sequences using BOXA1R primers for differentiation of bacteria. This study aimed to evaluate the genetic diversity of protease mirabilis isolated from urine specimens. Materials & Methods: In this descriptive cross-sectional study, 60 isolates protease mirabilis were identified from urine specimens using biochemical tests. DNA samples were extracted and tested for BOX-PCR. Findings: The tree diagram or dendrogram of BOX-PCR was drawn and the results showed that all strains were segregated into 7 separate clusters at a similarity level of 57%. There were three isolates in the first group, nine in the second group, 18 in the third group, two in the fourth group, 11 in the fifth group, one in the sixth group, and 16 isolates in the seventh group. Dandrogram analysis revealed that the strains belonging to a serovar are subtracted from each other. Discussion & Conclusions: This method demonstrated that molecular fingerprinting with BOXA1R primers is useful for typing bacterial isolates from different origins. Moreover, it has a really efficient differentiation power, it can be used effectively in epidemiological studies, and trace source of infection and taxonomy.