عنوان مقاله :
بررسي پايگاه هاي توالي آلرژن ها و تعيين پايگاه داده مناسب براي آناليز بيوانفورماتيكي آلرژنيسيته پروتئين هاي نوتركيب
پديد آورندگان :
الهياري فرد ، نجف پژوهشگاه ملي مهندسي ژنتيك و زيست فناوري , مينوچهر ، زرين پژوهشگاه ملي مهندسي ژنتيك و زيست فناوري , رهگذر ، مسعود دانشگاه تهران - گروه كامپيوتر , اورنگ ، عبدالمنان دانشگاه پيام نور اصفهان , فضيلتي ، محمد دانشگاه پيام نور اصفهان
كليدواژه :
آلــرژن , پايــگاه داده پروتئينــي , پروتئينهــاي نوتركيــب
چكيده فارسي :
براساس اعلام سازمان جهاني آلرژي؛ حدود يك سوم جمعيت جهان متاثر از آلرژياند. مطابق با ضوابط سازمان جهاني سلامت ارزيابي آلرژنيسيته پروتئينهاي نوتركيب ضروري است. ارزيابي آلرژنيسيته با پيشرفتهاي بدست آمده در آناليزهاي بيوانفورماتيكي و تعيين ساختار سه بعدي آلرژنها تسهيل شده است. آناليز بيوانفورماتيكي مرحله مقدماتي در ارزيابي آلرژنيسيته پروتئينهاي نوتركيب است كه نتايج آن در سنگيني مستندات و قضاوت آلرژنيسيته اهميت دارد. كارايي آناليز بيوانفورماتيكي آلرژنيسيته پروتئينهاي نوتركيب وابسته به ماهيت و محتواي پايگاههاي اطلاعاتي مورد استفاده در تحليل است. اين تحقيق با هدف بررسي و تعيين پايگاههاي داده توالي مناسب براي آناليز بيوانفورماتيكي آلرژنيسيته پروتئينهاي نوتركيب انجام شد. لذا پايگاههاي داده آلرژن پس از مطالعه تطبيقي در سه گروه الف عمومي، ب مولكولي و ج آناليز موتيف و اپيتوپ دستهبندي شد. نتايج نشان داد اين پايگاهها در حجم دادهها، سازماندهي و قابليتها متفاوت هستند. به منظور دستيابي به نتايج بهتر و دقيقتر، آناليز بيوانفورماتيكي آلرژنيسيته پروتئينهاي نوتركيب بايد بصورت تركيبي و بهرهمندي از گروهي از پايگاههاي اطلاعاتي آلرژنها انجام شود. بدليل گستره دادهها و الگوريتمهاي مختلف درباره پيشبيني آلرژنيسيته، پايگاه توالي آلرژنها شامل Allergome, ADFS, SDAP, FARRP و Alegpred براي آناليز بيوانفورماتيكي آلرژنيسيته پروتئينهاي نوتركيب توصيه ميشود. همچنين در اين تحقيق ارزيابي بيوانفورماتيكي آلرژنيسيته پروتئين اسموتين انجام شد. نتايج تحقيق حاكي از آن بود كه براساس آناليزهاي بيوانفورماتيكي اسموتين حساسيتزا است.
عنوان نشريه :
زيست شناسي كاربردي