بررسي توالي و ساختار مركزي در ساختمان الكل دهيدروژنازها

با هدف بررسي و شناسايي اسيدهاي آمينه‌ مهم از نظر ساختاري و عملكردي در خانواده الكل دهيدروژنازها كه در طول تكامل محافظت شده‌اند، تجزيه و تحليل كامپيوتري پيشرفته‌اي بر روي توالي و ساختار سه بعدي اين آنزيم‌ها انجام شد. آناليزتوالي با توجه به برخي خصوصيات اسيدهاي آمينه از جمله همساني، تشابه، انتروپي، هيدروفوبيسيتي براي تعيين سطح محافظت شدگي در هر جايگاه انجام گرفت. بر اساس محاسبات انجام شده، مناطق بسيار محافظت شده‌اي در ساختار و توالي الكل دهيدروژنازها شناسايي شدند. با آناليز بيشتر توالي‌ها و جايگاه‌هاي محافظت شده، معلوم شد كه در اين مناطق، خصوصيات مشتركي مشاهده مي‌شود. نتايج محاسبات در اين مطالعه نشان داد كه اين امكان وجود دارد كه در جايگاه‌هاي ويژه‌اي از ساختار اين آنزيم، الگوهاي محافظت شده خاصي تعريف شود و بر آن اساس، پايداري ساختاري آنزيم كه عامل غلبگي آن در طول تكامل است را توجيه كند. در اين مطالعه دو منطقه كاملاٌ محافظت شده كه الگوي مشخصي را در توالي خود در طول تكامل حفظ كرده‌اند، مشخص شدند. به نظر مي‌رسد اين موتيف ها در تغيير آرايش فضايي آنزيم بعد از اتصال به سوبسترا يك نقش مكانيكي به عنوان لولا داشته باشند.